Padrões e processos associados à diversidade da anurofauna em áreas abertas da América do Sul: filogeografia de physalaemus cuvieri (anura: leptodactylidae)

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dc.contributor.advisor-co1Maciel, Natan Medeiros
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2116561844584292por
dc.contributor.advisor1Collevatti, Rosane Garcia
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/9979596352166630por
dc.contributor.referee1Collevatti, Rosane Garcia
dc.contributor.referee2Werneck, Fernanda de Pinho
dc.contributor.referee3Amaro, Renata Cecilia
dc.contributor.referee4Silva, Daniela de Melo e
dc.contributor.referee5Bastos, Rogério Pereira
dc.creatorMiranda, Núbia Esther de Oliveira
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/2904685994546324por
dc.date.accessioned2016-09-01T12:06:59Z
dc.date.issued2014-03-21
dc.description.abstractPhylogeographic studies are revealing complex evolutionary histories in the South American diagonal of open formations. The phylogeographic patterns of South American biota are better documented for forest-dwelling species but remain insufficient in respect to open vegetation habitats. The frog Physalaemus cuvieri presents wide distribution being a typical species of open areas. It represents an ideal model to investigate hypotheses about the role of events of Tertiary versus Quaternary in the genetic diversity and diversification of the anurofauna of the Neotropical open areas. Here we used a range-wide sampling of P. cuvieri and DNA regions with different mutation rates to investigate historical and spatial process that promoted the species diversification. We integrated the phylogeographic approach with ecological niche models to understand how Miocene/Pliocene orogenic events and/or Pleistocene climatic oscillations have contributed to shape the current diversity and distribution of the species population. We sampled 609 individuals from 76 populations. Three mitochondrial fragments (12S, 16S and cytochrome b) and one nuclear (rhodopsin) were sequenced for all individuals. We identified 248 haplotypes in mitochondrial region and six haplotypes in nuclear region. It is possible to recognize three haplogroups, widely distributed in the network, which assemble sympatric and geographically close populations haplotypes. There is a clear separation between the haplotypes that shows a ‘diagonal break’ of the populations of P. cuvieri with their connnection occurring in the northeast through the haplotypes of São Luiz - MA population. The hierarchical AMOVA showed significant differentiation among populations of the different river basins (FCT = 0.273). The divergence between the lineages of P. cuvieri and outgroups occurred during the Miocene, around 16.13 Ma [SD 10.43 to 20.43]. Divergences between the major groups and subgroups occurred during the Miocene (between 16 and 5.7 Ma). Divergences in the Pleistocene occurred mainly within populations, or among geographically close populations. The analysis of spatial diffusion estimated the most recent dates for the dispersal events of the lineages of P. cuvieri. Much of their diversification remained registered in the Tertiary, although we can not neglect the influence of Quaternary climatic fluctuations. Lineages of P. cuvieri seems to have an origin at central Brazil, with three main routes of colonization: one towards the south, one to the north and other to the northwest. The potential distribution of P. cuvieri appears did not change drastically across the last glacial cycle. Our results revealed a complex history diversification of P. cuvieri, with Tertiary orogenic events playing prominent role in the early diversification, by also favored by the climatic fluctuations of the Quaternary. This process contributed to the diversification of younger lineages and also structured populations. Therefore, P. cuvieri shows a pattern of deep divergences with strong regional structuring of populations, despite its widespread distribution and generalized ecology. Because of that deep and structured divergence, Physalaemus cuvieri populations also should be treated as a species complexeng
dc.description.provenanceSubmitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-08-31T18:25:55Z No. of bitstreams: 2 Tese - Núbia Esther de Oliveira Miranda - 2014.pdf: 6845161 bytes, checksum: 4ccf0dcc5111a9deafeb3c852731bf7d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-09-01T12:06:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Núbia Esther de Oliveira Miranda - 2014.pdf: 6845161 bytes, checksum: 4ccf0dcc5111a9deafeb3c852731bf7d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
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dc.description.resumoTrabalhos filogeográficos têm evidenciando histórias evolutivas complexas na diagonal de áreas abertas sul-americanas que só agora começamos a compreender. Os padrões filogeográficos da biota sul-americana são melhor documentados para os ambientes florestais, sendo ainda incipientes no que diz respeito às paisagens abertas. A rã Physalaemus cuvieri foi escolhida neste trabalho por apresentar ampla distribuição e por ser uma espécie típica de áreas abertas, sendo um modelo adequado para testar hipóteses sobre o papel dos eventos do Terciário versus Quaternário na diversidade genética e distribuição das linhagens de anurofauna de áreas abertas da região Neotropical. Aqui nós utilizamos uma ampla amostragem de indivíduos de P. cuvieri e utilizamos regiões de DNA com diferentes taxas de mutação para investigar os fatores históricos e espaciais que promoveram a diversificação da espécie. Nós integramos a abordagem filogeográfica com a modelagem da paleodistribuição, para compreender como os eventos orogênicos do Mioceno e Plioceno e/ou as oscilações climáticas do Pleistoceno influenciaram em sua diversificação. Foram amostrados 609 indivíduos em 76 localidades. Três fragmentos mitocondriais (12S, 16S e citocromo b) e um gene nuclear (rodopsina) foram sequenciados para todos os indivíduos. Foram identificados 248 haplótipos para a região mitocondrial e seis haplótipos na região nuclear. É possível reconhecer três haplogrupos, amplamente distribuídos, na rede de haplótipos, os quais reúnem haplótipos simpátricos e/ou de populações próximas geograficamente, sendo que há uma clara separação entre os haplótipos evidenciando uma “quebra” em diagonal separando as populações de P. cuvieri, com a ligação entre elas ocorrendo à nordeste por meio dos haplótipos da população de São Luiz – MA. A AMOVA hierárquica mostrou uma diferenciação significativa entre as populações presentes nas diferentes bacias hidrográficas (FCT = 0,273). A divergência entre as linhagens de P. cuvieri e o grupo externo ocorreu no Mioceno há 16.13 [SD 10.43–20.43] milhões de anos. As principais divergências entre os grandes grupos e os subgrupos que os compõem ocorreram principalmente no Mioceno (entre 16 – 5.7 milhões) e Plioceno (4.92 – 2.69 milhões). As divergências no Pleistoceno ocorreram principalmente dentro de populações ou entre linhagens muito próximas geograficamente. A análise de difusão espacial estimou datas mais recentes para os eventos de dispersão das linhagens de P. cuvieri, ainda assim boa parte da diversificação das linhagens continuou sendo registrada no Terciário, ainda que não se possa negar certa influência dos eventos climáticos do Quaternário. A origem das linhagens de P. cuvieri foi estimada para a região central do Brasil de onde partiram três principais rotas de colonização: uma em direção ao sul, outra para o norte e uma para noroeste. A distribuição potencial de P. cuvieri ao longo do último ciclo glacial pouco mudou, tanto em área quanto em localização geográfica. Nossos resultados revelam uma complexa história de diversificação de P. cuvieri, com os eventos orogênicos do Terciário exercendo papel fundamental no início de sua diversificação, que foi contínua e favorecida pelas flutuações climáticas do Quaternário, que contribuiu muito mais com a diversificação das linhagens mais jovens e com estruturação populacional. Em suma, P. cuvieri apresenta um padrão de divergências profundas e com forte estruturação regional de suas populações apesar de sua ampla distribuição e hábitos generalistas. Devido a este forte padrão divergente P. cuvieri deve ser tratada como um complexo críptico de espécies.por
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationMIRANDA, N. E. O. Padrões e processos associados à diversidade da anurofauna em áreas abertas da América do Sul: filogeografia de physalaemus cuvieri (anura: leptodactylidae). 2014. 120 f. Tese (Doutorado em Ecologia e Evolução) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2014.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/6071
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicas - ICB (RG)por
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ecologia e Evolução (ICB)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectGenética de populaçõespor
dc.subjectBiogeografiapor
dc.subjectLeiuperinaepor
dc.subjectCerradopor
dc.subjectAnurofaunapor
dc.subjectPopulation geneticseng
dc.subjectBiogeographyeng
dc.subjectLeiuperinaeeng
dc.subjectCerradoeng
dc.subjectAnurofaunaeng
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIApor
dc.titlePadrões e processos associados à diversidade da anurofauna em áreas abertas da América do Sul: filogeografia de physalaemus cuvieri (anura: leptodactylidae)por
dc.title.alternativePatterns and processes associated with anurofauna diversity in the South American of open formations: phylogeography of physalaemus cuvieri (anura: leptodactylidae)eng

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