Diversidade e estrutura genética de Pterodon emarginatus vogel (leguminosae) no cerrado

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dc.contributor.advisor1Soares, Thannya Nascimento
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5590256762396056pt_BR
dc.contributor.referee1Soares, Thannya Nascimento
dc.contributor.referee2Chaves, Lázaro José
dc.contributor.referee3Rocha, Dulce Maria Sucena da
dc.creatorSousa, Daniel Ferreira de
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3297616186097793pt_BR
dc.date.accessioned2020-09-04T11:18:45Z
dc.date.available2020-09-04T11:18:45Z
dc.date.issued2020-06-29
dc.description.abstractPterodon emarginatus Vogel, popularly known as white sucupira, has characteristics that allow its exploitation as a timber, ornamental and medicinal resource. Knowing the genetic variability in natural populations of a plant genetic resource is important for defining strategies for its use and conservation. The present study had as objective to know the genetic diversity of natural populations of P. emarginatus in the Brazilian cerrado, for use and conservation purposes. 302 individuals were collected, from 13 Brazilian cerrado populations. These individuals were analyzed using 10 microsatellite markers. The detection of the genotypes was performed using the ABI-3500 genetic analyzer (Applied Biosystems). The quality of the loci was evaluated based on estimates of probability of identity and probability of exclusion of paternity, in the Identity4 program. The analyzes of diversity and genetic population structure were performed in the GDA programs and by the hierfstat package, in environment R. The cluster analysis was performed by the Bayesian method, using the STRUCUTRE program. The genetic divergence (pairwise FST) and the Mantel test were estimated, using the hierfstat and Vegan packages in environment R. The presence of genetic discontinuity was verified with the application of the Monmonier algorithm. The identification of priority populations for conservation was performed by the Greedy algorithm, in an R environment. The battery of loci proved to be adequate for the analysis of individual discrimination and for population genetic studies, since the probability of identity was low (PI = 2, 4109 x 10-11) and the exclusion of paternity was high (Q = 0.9999). An average of 15.9 alleles were identified per locus. The observed heterozygosity (0.521) was less than the expected heterozygosity (0.654). The populations exhibited a significant population genetic structure (θp = 0.104), with the presence of inbreeding due to the reproductive system (f = 0.207). The inbreeding of the population group was also high and significant (F = 0.290). Six groups were detected by Bayesian analysis. No relationship was detected between genetic and geographical distance. The populations of Araguaçu TO and Porangatu GO showed genetic discontinuity with four other populations. It was not possible to establish a minimum number of priority populations for conservation, as there is a need to conserve all of them (13) in order to sample all the alleles identified in the present study. This study reveals that the natural populations of P. emarginatus have high genetic diversity, but this diversity .is structured among populations and that there is inbreeding within populations due to the reproductive system. In addition, the genetic divergence is not explained by the geographical distance and the populations have a low redundancy of allelic richness. Such results imply the need for a greater sampling effort, both of individuals and populations, in works aimed at the conservation and use of the species.por
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dc.description.resumoPterodon emarginatus Vogel, conhecida popularmente como sucupira-branca, possui características que possibilitam a sua exploração como recurso madeireiro, ornamental e medicinal. Conhecer a variabilidade genética nas populações naturais de um recurso genético vegetal é importante para a definição de estratégias para o seu uso e conservação. O presente estudo teve como objetivo conhecer a diversidade genética de populações naturais P. emarginatus no Cerrado, para fins de uso e conservação. Foram coletados 302 indivíduos, provenientes de 13 populações do Cerrado. Esses indivíduos foram analisados com 10 marcadores microssatélites. A detecção dos genótipos foi realizada pelo emprego do analisador genético ABI-3500 (Applied Biosystems). A qualidade dos locos foi avaliada com base em estimativas de probabilidade de identidade e da probabilidade de exclusão de paternidade, no programa Identity4. As análises de diversidade e estrutura genética populacional foram realizadas nos programas GDA e pelo pacote hierfstat, em ambiente R. Foi realizada a análise de agrupamento por método bayesiano, com o uso do programa STRUCUTRE. Foi estimada a divergência genética (FST par a par) e o teste de Mantel, com o uso dos pacotes hierfstat e Vegan em ambiente R. A presença de descontinuidade genética foi verificada com a aplicação do algoritmo de Monmonier. A identificação de populações prioritárias para conservação foi realizada pelo algoritmo Greedy, em ambiente R. A bateria de locos se mostrou adequada para a análises de discriminação individual e para estudos genético populacionais, uma vez que a probabilidade de identidade foi baixa (PI = 2,4109 x 10-11) e a exclusão de paternidade foi alta (Q = 0,9998). Foram identificados 15,9 alelos em média, por loco. A heterozigosidade observada (0,521) foi menor do que a heterozigosidade esperada (0,654). As populações exibiram estrutura genética populacional significativa (θp = 0,104), com presença de endogamia decorrente do sistema reprodutivo (f = 0,207). A endogamia do conjunto de populações também foi alta e significativa (F = 0,290). Foram detectados seis grupos genéticos pela análise Bayesiana. Não foram detectadas relações entre a distância genética e geográfica. As populações de Araguaçu-TO e Porangatu-GO apresentaram descontinuidade genética com quatro populações. Não foi possível estabelecer um número mínimo de populações prioritárias para conservação, pois há a necessidade de se conservar todas elas (13) para se amostrar todos os alelos identificados no presente estudo. Este estudo revela que as populações naturais de P. emarginatus apresentam alta diversidade genética, porém esta diversidade está estruturada nessas populações que, ainda, apresentam endogamia decorrente do sistema reprodutivo. Além disso, a divergência genética não é explicada pela distância geográfica e as populações apresentam baixa redundância de riqueza alélica. Tais resultados implicam na necessidade de um maior esforço amostral, tanto de indivíduos, quanto de populações, em trabalhos que visem a conservação e uso da espécie.pt_BR
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpt_BR
dc.identifier.citationSOUSA, D. F. Diversidade e estrutura genética de Pterodon emarginatus vogel (leguminosae) no cerrado. 2020. 56 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2020.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/10553
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentEscola de Agronomia - EA (RG)pt_BR
dc.publisher.initialsUFGpt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EA)pt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/*
dc.subjectGenética da conservaçãopor
dc.subjectMicrossatélitespor
dc.subjectRecurso genéticopor
dc.subjectSucupira-brancapor
dc.subjectConservation geneticseng
dc.subjectGenetic resourceseng
dc.subjectMicrosatelliteseng
dc.subjectSucupira-brancaeng
dc.subject.cnpqCIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIApt_BR
dc.titleDiversidade e estrutura genética de Pterodon emarginatus vogel (leguminosae) no cerradopt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR

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