Efeito de solvatação explícita nas propriedades eletrônicas de peptóides fluorescentes via metodologia QM/MM sequencial
dc.contributor.advisor1 | Oliveira, Heibbe Cristhian Benedito de | |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/5995553993631378 | pt_BR |
dc.contributor.referee1 | Oliveira, Heibbe Cristhian Benedito de | |
dc.contributor.referee2 | Franco Junior, Adolfo | |
dc.contributor.referee3 | Gargano, Ricardo | |
dc.creator | Souza, Shamon Henrique Feitosa de | |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/2621391557286636 | pt_BR |
dc.date.accessioned | 2023-04-03T13:25:28Z | |
dc.date.available | 2023-04-03T13:25:28Z | |
dc.date.issued | 2023-02-23 | |
dc.description.abstract | In this work, we investigated the photophysical properties of four recently synthesized peptoids employing Quantum Chemistry calculations. The environment in which the solute is inserted can directly influence its properties, as the interactions of the solute with other molecules directly affect the geometric and electronic structure of the entire system. Therefore, in this work we use explicit solvation methods, in which each solvent molecule is explicitly treated and the total contribution of solvent molecules is included in the system, thus providing a better approximation between theoretical and experimental values. We studied the effect of explicit solvent treatment on the electronic properties of fluorescent peptoids, solvated in five different solvents, through computer simulations using a hybrid methodology (QM/MM). Sequentially to the Monte Carlo calculations (ASEC via DICE program) ab initio quantum calculations were performed in which we used several exchange-correlation functionals in order to identify which is the most suitable for the studied peptoids and analogous systems. The results obtained via theoretical calculations were compared with the experimental results published by Wender et al. (2016). With that, we developed a computational protocol comparable to the experimental values. | eng |
dc.description.provenance | Submitted by Leandro Machado (leandromachado@ufg.br) on 2023-03-27T15:27:29Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Shamon Henrique Feitosa de Souza - 2023.pdf: 3919554 bytes, checksum: 862e7283eef27d22ab86a5a8f7b60a3b (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5) | en |
dc.description.provenance | Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2023-04-03T13:25:28Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Shamon Henrique Feitosa de Souza - 2023.pdf: 3919554 bytes, checksum: 862e7283eef27d22ab86a5a8f7b60a3b (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5) | en |
dc.description.provenance | Made available in DSpace on 2023-04-03T13:25:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Shamon Henrique Feitosa de Souza - 2023.pdf: 3919554 bytes, checksum: 862e7283eef27d22ab86a5a8f7b60a3b (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5) Previous issue date: 2023-02-23 | en |
dc.description.resumo | O presente projeto foi baseado na aplicação de cálculos de Química Quântica Computacional para a investigar propriedades fotofísicas de quatro peptóides recentemente sintetizados. O ambiente em que está inserido o soluto pode influenciar diretamente em suas propriedades, pois as interações do soluto com as demais moléculas afetam diretamente a estrutura geométrica e eletrônica de todo o sistema. Portanto, neste trabalho utilizamos de métodos explícitos de solvatação, em que cada molécula de solvente é explicitamente tratada e a contribuição total das moléculas de solvente é incluída no sistema, proporcionando assim uma melhor aproximação entre os valores teóricos e experimentais. Estudamos o efeito do tratamento explícito de solvente nas propriedades eletrônicas de peptóides fluorescentes, solvatados em cinco diferentes solventes, por meio de simulações computacionais utilizando uma metodologia híbrida (QM/MM). Sequencialmente aos cálculos de Monte Carlo (ASEC via programa DICE) foram realizados cálculos quânticos ab initio em que utilizamos vários funcionais de troca-correlação com o objetivo de identificar qual é o mais adequado para os peptóides estudados e sistemas análogos. Os resultados obtidos via cálculos teóricos foram comparados com os resultados experimentais publicados por Wender et al. (2016). Com isso, desenvolvemos um protocolo computacional comparável aos valores experimentais. | pt_BR |
dc.identifier.citation | SOUZA, S. H. F. Efeito de solvatação explícita nas propriedades eletrônicas de peptóides fluorescentes via metodologia QM/MM sequencial. 2023. 68 f. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2023. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/12711 | |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal de Goiás | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.publisher.department | Instituto de Química - IQ (RMG) | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFG | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-graduação em Química (IQ) | pt_BR |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | * |
dc.subject | Peptóides | por |
dc.subject | Química quântica | por |
dc.subject | DFT | por |
dc.subject | Solvente | por |
dc.subject | Propriedades fotofísicas | por |
dc.subject | ASEC | por |
dc.subject | Peptoids | eng |
dc.subject | Quantum chemistry | eng |
dc.subject | DFT | eng |
dc.subject | Solvent | eng |
dc.subject | Photophysical properties | eng |
dc.subject | ASEC | eng |
dc.subject.cnpq | OUTROS | pt_BR |
dc.title | Efeito de solvatação explícita nas propriedades eletrônicas de peptóides fluorescentes via metodologia QM/MM sequencial | pt_BR |
dc.title.alternative | Explicit solvatation effect on the electronic properties of fluorescent peptoids via sequential QM/MM methodology | eng |
dc.type | Dissertação | pt_BR |
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