Estrutura e variabilidade do promotor do gene do fator de necrose tumoral humano (TNF)

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dc.contributor.advisor-co1Castelli, Erick da Cruz
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0992559318175235eng
dc.contributor.advisor1Silva, Daniela de Melo e
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/9895211901348365eng
dc.contributor.referee1Silva, Cláudio Carlos da
dc.contributor.referee2Soares, Thannya Nascimento
dc.creatorLopes, Mariana Paiva
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/8698011517650065eng
dc.date.accessioned2017-09-19T13:59:44Z
dc.date.issued2014-03-12
dc.description.abstractThe gene for tumor necrosis factor (TNF) is located in the human MHC central region known as class III (Major Histocompatibility Complex). This gene encodes an important pro- inflammatory cytokine produced primarily by macrophages, and it has been associated with several diseases, such as autoimmune and degenerative ones. Studies indicate that TNF polymorphisms may influence their level of expression and activity and therefore could influence susceptibility to tumors. Whereas the bladder urothelium can constantly be the target of inflammatory processes and as the main forms of treatment of bladder tumors are immunotherapy, the genetic profile of an individual can influence susceptibility to this type of injury. In this study, we analyzed the structure and variability of the regulatory region of the TNF gene in Brazilian samples and the results were compared with data obtained by 1000Genomes project. A study of association between polymorphisms of the promoter region of TNF and bladder carcinoma patients in the state of São Paulo in Ribeirão Preto, in our analysis was conducted there was no relationship of the data found with bladder carcinoma. In all evaluated populations we found 15 variation points, found in 11 Brazilian and 15 variation points found in the 1000Genomes data, these variation points are arranged in 20 different haplotypes. These haplotypes with comparisons involving primate sequences indicated that one allele arose before the main speciation and human dispersion. Two strains were defined by haplotype relationships and are probably very old in human evolutionary history, since all populations evaluated showed haplotypes belonging to each of these strains. The frequency of haplotype H01 is the highest among all populations evaluated. However, the haplotype H12, although at reduced frequency compared to H01 is probably the oldest haplotype in part by the second line being shared with other primates.por
dc.description.provenanceSubmitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2017-09-13T17:35:41Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Paiva Lopes - 2014 .pdf: 2192084 bytes, checksum: e551c174d821b3b398247680a94c40cd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
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dc.description.resumoO gene do Fator de Necrose Tumoral (TNF) humano está localizado no MHC (Complexo Principal de Histocompatibilidade) central, região conhecida como classe III. Este gene codifica uma citocina pró-inflamatória importante, produzida principalmente por macrófagos, que tem sido relacionada com diversas doenças, como as autoimunes e as degenerativas. Estudos indicam que polimorfismos do TNF podem influenciar seu nível de expressão e atividade e, portanto, poderiam influenciar a susceptibilidade a tumores. Considerando que o urotélio vesical pode ser constantemente alvo de processos inflamatórios e que as principais formas de tratamento de tumores vesicais são imunoterápicos, o perfil genético de um indivíduo pode influenciar a susceptibilidade a esse tipo de lesão. Neste estudo analisamos a estrutura e a variabilidade da região regulatória do gene TNF em amostras brasileiras e os resultados foram comparados com dados obtidos pelo projeto 1000Genomes. Foi realizado um estudo de associação entre polimorfismos da região promotora do TNF e o carcinoma vesical em pacientes do estado de São Paulo da cidade de Ribeirão Preto, nas nossas análises não houve relação dos dados encontrados com o carcinoma vesical. Considerando todas as populações avaliadas foram encontrados 15 pontos de variação, 11 encontrados nas amostras brasileiras e 15 encontrados nos dados do projeto 1000Genomes, esses pontos de variação estão arranjados em 20 haplótipos diferentes. Esses haplótipos em conjunto com as comparações envolvendo sequências de primatas indicam que um alelo principal surgiu antes da especiação e dispersão humana. Duas linhagens foram definidas pelas relações haplotípicas e são, provavelmente, muito antigas na história evolutiva humana, já que todas as populações avaliadas apresentaram haplótipos pertencentes a cada uma destas linhagens. A frequência do haplótipo H01 é a mais alta entre todas as populações avaliadas. No entanto, o haplótipo H12, embora com frequência reduzida quando comparado com o H01, provavelmente é o haplótipo mais antigo em parte por esta segunda linhagem ser compartilhada com outros primatas.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESeng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationLOPES, Mariana Paiva. Estrutura e variabilidade do promotor do gene do fator de necrose tumoral humano (TNF). 2014. 53 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2014.eng
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/7768
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicas - ICB (RG)eng
dc.publisher.initialsUFGeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Genética e Biologia Moleculareng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectComplexo principal de histocompatibilidadepor
dc.subjectFator de necrose tumoralpor
dc.subjectCarcinoma vesicalpor
dc.subjectDesequilíbrio de ligaçãopor
dc.subjectHaplótipospor
dc.subjectMajor histocompatibility complexeng
dc.subjectTumor necrosis factoreng
dc.subjectbladder carcinomaeng
dc.subjectLinkage disequilibriumeng
dc.subjectHaplotypeseng
dc.subject.cnpqBIOQUIMICA::BIOLOGIA MOLECULAReng
dc.titleEstrutura e variabilidade do promotor do gene do fator de necrose tumoral humano (TNF)eng
dc.typeDissertaçãoeng

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Mestrado em Genética e Biologia Molecular (ICB)