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Tipo do documento: Tese
Título: SNPs e microssatélites na caracterização racial e de resistência a enfermidades em bovinos da raça Curraleiro Pé-Duro
Título(s) alternativo(s): SNPs and microssatellites in the genetic characterization and diseases resistance of Curraleiro Pé-Duro bovine breed
Autor: Freitas, Thais Miranda Silva
Currículo Lattes do Autor: http://lattes.cnpq.br/0090877254263290
Primeiro orientador: Fioravanti, Maria Clorinda Soares
Currículo Lattes do primeiro orientador: http://lattes.cnpq.br/8772502020076257
Primeiro coorientador: Carmo, Adriana Santana do
Currículo Lattes do primeiro coorientador: http://lattes.cnpq.br/0782572407995106
Segundo Coorientador: Moura, Maria Ivete de
Currículo Lattes do segundo coorientador: http://lattes.cnpq.br/9636259477810298
Primeiro membro da banca: Fioravanti, Maria Clorinda Soares
Segundo membro da banca: Landi, Vincenzo
Terceiro membro da banca: Cruz, Aparecido Divino da
Quarto membro da banca: Jayme, Valéria de Sá
Quinto membro da banca: Badr, Kareem Rady
Resumo: A raça bovina local brasileira Curraleiro Pé-Duro é patrimônio genético que tem como características rusticidade, adaptabilidade às condições ambientais e resistência a doenças e intoxicações. Objetivou-se com este estudo observar a variabilidade genética em populações da raça, verificando a ocorrência de marcadores SNP e microssatélites para caracterização racial e resistência a infeções por Brucella abortus, Leptospira spp, Neospora caninum, e pelos vírus da leucose, rinotraqueite infecciosa e diarreia viral bovina. Foram usadas 1.182 amostras de bovinos pertencentes ao banco de dados da Rede Pró-Centro-Oeste. Foi realizada amplificação e genotipagem de 28 marcadores microssatélites de caracterização racial e 13 relacionados aos genes do complexo antígeno leucocitário bovino (BoLA). Foram investigados 24 polimorfismos de base única (SNP) em genes relacionados à expressão de citocinas por meio da técnica Kompetitive Allele-Specific PCR. Os genótipos foram associados aos fenótipos por análise univariada, seguida de regressão logística, considerando nível de significância de 5%. A análise Bayesiana agrupou os animais em três clusters raciais, indicando a presença de subpopulação, com similar prevalência das infecções. As heterozigosidades e os valores de FST, FIT e FIS indicaram pouca diferenciação entre os clusters e homozigosidade aumentada. Foram identificados 42 alelos no gene BoLA associados às infecções. Os haplótipos SNPs no BTA6 e BTA15 foram mais frequentes em animais soronegativos enquanto o haplótipo 2 do BTA17 esteve presente em 70% dos animais positivos contra Neospora caninum. A raça Curraleiro Pé-Duro possui alelos de resistência a infecções que podem se perder devido à perda da diversidade genética da raça.
Abstract: The Brazilian cattle breed Curraleiro Pé-Duro is an important genetic resource that has as characteristics of rusticity, adaptability to environmental conditions, and resistance to diseases and intoxications. This study aims to analyze the genetic diversity of Curraleiro Pé-Duro populations and verify the presence of SNPs and microsatellite polymorphisms for breed characterization and disease resistanceto Brucella abortus, Leptospira spp, Neospora caninum, leukosis virus, Infectious Bovine Rhinotracheitis, and Bovine Viral Diarrhea. A total of 1.182 serum and blood samples of Curraleiro Pé-Duro breed belonging to the Pro-Centro-Oeste Network database were used. Amplification and genotyping of 28 microsatellite markers of breed characterization and 13 markers related to the bovine leukocyte antigen (BoLA) and SLC11A genes were used. Twenty-four single-base polymorphisms (SNPs), detected by Kompetitive Allele-Specific PCR, were investigated in genes related to cytokines expression. Univariate analysis was performed for the association of genotypes with phenotypes, followed by logistic regression considering a significance level of 5%. Bayesian analysis grouped the animals into three breed clusters, indicating the presence of subpopulation, with similar prevalence for infections. Heterozygosity and Fst values indicated little differentiation between clusters and increased homozygosity. On BoLA gene, 42 allels associated to infections were identified. SNP haplotypes in BTA6 and BTA15 were significant in seronegative animals while BTA17 haplotype 2 was presented in 70% of Neospora caninum positive animals. The results showed that Curraleiro Pé-Duro cattle breed has alleles of resistance to infections that can be lost due to loss of genetic diversity.
Palavras-chave: Gene BoLA
Marcadores moleculares
Raça local brasileira
BoLA gene
Brazilian cattle breed
Molecular markers
Área(s) do CNPq: CIENCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS::TECNOLOGIA DE ALIMENTOS
Idioma: por
País: Brasil
Instituição: Universidade Federal de Goiás
Sigla da instituição: UFG
Departamento: Escola de Veterinária e Zootecnia - EVZ (RG)
Programa: Programa de Pós-graduação em Ciência Animal (EVZ)
Citação: FREITAS, T. M. S. SNPs e microssatélites na caracterização racial e de resistência a enfermidades em bovinos da raça Curraleiro Pé-Duro. 2018. 102 f. Tese (Doutorado em Ciência Animal) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2018.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
Endereço da licença: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
URI: http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/9838
Data de defesa: 5-Dez-2018
Aparece nas coleções:Doutorado em Ciência Animal (EVZ)

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