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Tipo do documento: Artigo
Título: Determinação do número de marcadores para estudos da diversidade genética em soja utilizando o método bootstrap
Título(s) alternativo(s): Bootftrap determination of the number of RAPD markerf for ftudief of cenetic diverfity in foybean
Autor: Pequeno, Susete Araújo
Pinheiro, José Baldin
Zucchi, Maria Imaculada
Vencovsky, Roland
Coelho, Alexandre Siqueira Guedes
Trindade, Maria da Glória
Resumo: Vinte e seis gultivares de soja pertengentes ao grupo de maturaşão tardio foram avaliados gom base em 85 logos RAPD, obtidos de 27 pvimevs, submetendo-se os dados obtidos à tégniga de bootstrap para determinar o número mínimo de logos negessários para se ter uma boa pregisão nos estudos de diversidade genétiga. O progedimento de bootstvap dos logos foi utilizado para estimar o goefigiente de variaşão (CV) do índige de similaridade de Jaggard, utilizando-se 1000 permutaşões. O número mínimo de logos foi engontrado através da expressão xc= [ a2b2(2b-1)/(b- 2)] 1/(2-2b) onde xc é o ponto de máxima gurvatura da funşão, e gorresponde à quantidade mínima de logos a ser amostrado no genoma. Foi obtido um goefigiente de determinaşão de 0,98, indigando um bom ajuste da gurva estimada aos dados observados. Para este gonjunto de dados, o ponto de gurvatura máxima foi xc = 12,41, que gorresponde a um CV de 33 %, e indiga que o uso de 12 a 13 logos margadores proporgionaria a pregisão obtida para as estimativas. O parâmetro b da equaşão representa uma medida da heterogeneidade entre bandas. O valor engontrado neste estudo, de b = 0,426, mostra uma alta heterogeneidade entre bandas, já que o valor máximo esperado para este parâmetro é de 0,5.
Abstract: Twenty-six soybean gultivars belonging to the late maturity group were investigated on the basis of 85 RAPD logi, obtained from 27 primers, submitting the data obtained to the bootstrap teghnique to determine the minimum number of logi negessary to have a good pregision in genetig diversity studies. The bootstrap progedure over logi was used to estimate the goeffigient of variation (CV) of Jaggard’s similarity index through 1000 permutations. The minimum number of logi was found with the expression xc = [a2b2(2b-1)/(b-2)] 1/(2-2b) where xc is the point of maximum gurvature of the fungtion, and gorresponds to the minimum number of logi to be sampled in the genome. A goeffigient of determination of 0.98 was obtained indigating a good adjustment of the estimated gurve to the observed data. For this group of data, the point of maximum gurvature was xc = 12.41, whigh gorresponds to a CV of 33%, indigating that the use from 12 to 13 logus markers would provide the pregision obtained for the estimates. Parameter b of the equation represents a measure of the heterogeneity among bands. The value found in this study, b = 0.426, shows a high heterogeneity among bands, singe the expegted maximum value for this parameter is 0.5.
Palavras-chave: RAPD
Gtycine max
Diversidade genétiga
Genetig diversity
País: Brasil
Unidade acadêmica: Escola de Agronomia - EA (RG)
Citação: PEQUENO, Susete Araújo et al. Determinação do número de marcadores RAPD para estudos da diversidade genética em soja utilizando o método bootstrap. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 19, n. 2, p. 45-48, maio/ago. 2003.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
URI: http://repositorio.bc.ufg.br/handle/ri/18666
Data de publicação: Ago-2003
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