Desenvolvimento de superfícies de resistência explicando a variação genética por modelagem orientada por padrão: uma análise com espécies de árvores de cerrado

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dc.contributor.advisor-co1Dobrovolski, Ricardo
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/7711175971556516por
dc.contributor.advisor1Diniz Filho, José Alexandre Felizola
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0706396442417351por
dc.contributor.referee1Diniz Filho, José Alexandre Felizola
dc.contributor.referee2Soares, Thannya Nascimento
dc.contributor.referee3Bini, Luis Mauricio
dc.contributor.referee4Rangel, Thiago F.
dc.contributor.referee5Telles, Mariana Pires de Campos
dc.creatorSilva e Souza, Kelly da
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/6886695900279003por
dc.date.accessioned2016-10-18T16:44:37Z
dc.date.issued2016-04-25
dc.description.abstractTo understand how landscape features spatially affect the genetic structure of a population , we propose the creation of resistance surfaces using an approach Pattern Oriented Modeling of genetic divergence (FST parwise) among baru populations (Dipteryx alata). To compose the resistance surface, we employed land use layers in an area of 25 baru populations, generating 10000 resistance surfaces with randomized cost values between 0 and 100. We use these surfaces to calculate matrices pairwise effective resistance to the circuitscap. Mantel test and its variations revealed a correlation of FST parwise with geographical distance of 0.48. The correlation between FST pairwise and the resistance matrices ranged between r = -0.2019 and r= 0.6736. We used multiple regression matrices to select the best (most satisfactory) models through Akaike (AIC). Three models were selected to contain the parameters that best explain the genetic divergence with ΔAIC below three. The ΔAIC values were used to calculate the AIC-weight (WI) and evaluate the individual contribution of each parameter in the selected surfaces. The selected models suggest that the areas with lower resistance are characterized as Savanna Arboreo Dense and Savanna Grassy Woody. Roads, big rivers, and agricultural lands cause higher resistance.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2016-10-18T14:14:08Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kelly da Silva e Souza - 2016.pdf: 2710469 bytes, checksum: cbe461f0d7a743f38a8a7043c982acf0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2016-10-18T16:44:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kelly da Silva e Souza - 2016.pdf: 2710469 bytes, checksum: cbe461f0d7a743f38a8a7043c982acf0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2016-10-18T16:44:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kelly da Silva e Souza - 2016.pdf: 2710469 bytes, checksum: cbe461f0d7a743f38a8a7043c982acf0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-04-25eng
dc.description.resumoPara entendermos como as características da paisagem afetam espacialmente a estrutura genética populacional, propomos a criação de superfícies de resistência utilizando uma abordagem de Modelagem Orientada pelo Padrão da divergência genética (FST) entre as populações de baru (Dipteryx alata), uma árvore amplamente distribuída na região do Cerrado do Brasil Central. Para compor as superfícies de resistência, utilizamos camadas de uso da terra na área em que as 25 populações de baru em estudo estão inseridas. Geramos 10 mil superfícies de resistência com valores de custo aleatorizados entre 0 e 100 em intervalos de 1. Usamos essas superfícies para calcular matrizes de resistência efetiva par-a-par com o circuitscape, um programa que calcula os valores de resistência fazendo uma analogia entre a conectividade elétrica e os dados genéticos da espécie em estudo. Calculamos testes de Mantel e suas variações entre o FST e cada uma das matrizes de resistências. A correlação do FST par-a-par com a distância geográfica, foi de 0,48. Para a correlação entre FST par a par e as matrizes de resistência, os testes de Mantel resultaram em coeficientes de correlação variando entre r = -0,2019 e r = 0,6736. Usamos a regressão múltipla de matrizes para seleção dos melhores modelos pelo critério de Akaike (AIC). Três modelos foram selecionados como sendo os que contém os parâmetros que melhor explicam a divergência genética pelo critério de Akaike com ΔAIC menor que 3. Os valores ΔAIC foram usados para calcular o peso do AIC em cada modelo (wi) e foram utilizados para avaliar a contribuição individual de cada parâmetro nas superfícies selecionadas. Modelos selecionados sugerem que as áreas com menor resistência são as caracterizadas por Cerrado de Savana Arbóreo Densa (cerradão) e Savana Gramíneo Lenhosa (campo limpo). As estradas, grandes rios e áreas agrícolas do Cerrado causam maior resistência.por
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationSOUZA, K. S. Desenvolvimento de superfícies de resistência explicando a variação genética por modelagem orientada por padrão: uma análise com espécies de árvores de cerrado. 2016. 71 f. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Evolução) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2016.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/6416
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicas - ICB (RG)por
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ecologia e Evolução (ICB)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectGenética na paisagempor
dc.subjectGenética de populaçõespor
dc.subjectResistênciapor
dc.subjectLandscape geneticseng
dc.subjectPopulations geneticseng
dc.subjectResistanceeng
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIApor
dc.titleDesenvolvimento de superfícies de resistência explicando a variação genética por modelagem orientada por padrão: uma análise com espécies de árvores de cerradopor
dc.title.alternativeDevelopment of resistance surfaces explaining genetic variation using pattern oriented modeling: analysis with cerrado tree specieseng
dc.typeDissertaçãopor

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