Construção e análise de uma biblioteca de cDNA de Trichoderma harzianum crescido na presença de parede celular de Fusarium solani

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dc.contributor.advisor-co1SILVA, Roberto do Nascimento
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5771309284349109por
dc.contributor.advisor1ULHOA, Cirano Jose
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8368469162867277por
dc.creatorSTEINDORFF, Andrei Stecca
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3464666284775598por
dc.date.accessioned2014-07-29T15:16:27Z
dc.date.available2010-09-09
dc.date.issued2010-02-26
dc.description.abstractSpecies of Trichoderma are commercially applied as biological control agents against plant fungal pathogens. Their action is based on a set of events, such as the production of antifungal metabolites, competition for space and nutrients and mycoparasitism. However the biocontrol mechanism of the interaction between Trichoderma harzianum and Fusarium solani is not yet understanded at the transcriptome level. This study aimed to initiate the preliminary development of an expressed sequence tag (EST) database for Trichoderma harzianum and thereby gain potentially useful information on Trichoderma gene sequences in order to elucidate the integrated biocontrol mechanism. Partial sequencing of anonymous cDNA clones is a widely used technique for gene identification. A directional cDNA library has been constructed from mycelium of Trichoderma harzianum grown on cell wall isolated from Fusarium solani. 3984 clones have been randomly selected, subjected to single-pass sequencing from the 5 end of the vector, and identified by sequence similarity searches against gene sequences in GenBank fungal database. Of the 3984 mycelium clones, 40.8% exhibit similarity to known genes. Analysis of the identified clones indicated sequence similarity to a broad diversity of genes encoding proteins such as enzymes, structural proteins, and regulatory factors. A significant proportion of genes identified were involved in processes related to mycoparasitism (3,81%), as would be expected in biocontrol fungus. These results present the successful application of EST analysis in the interaction of Trichoderma harzianum and Fusarium solani to provide a preliminary indication of gene expression.eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2014-07-29T15:16:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao andrei.pdf: 2548450 bytes, checksum: dedf19335cba3686a528075fb5da8300 (MD5) Previous issue date: 2010-02-26eng
dc.description.resumoEspécies do gênero Trichoderma são comercialmente aplicadas como agentes de controle biológico contra fungos patógenos de plantas. Sua ação é baseada em diferentes mecanismos como a produção de antibióticos voláteis e não-voláteis, competição por espaço e nutrientes e micoparasitismo. O mecanismo de biocontrole da interação entre Trichoderma harzianum e Fusarium solani ainda não foi explorado ao nível de transcriptoma. Este estudo buscou iniciar o desenvolvimento de uma base de dados de EST (Expressed Sequence Tags) para assim obter informações úteis nas sequências de Trichoderma harzianum e entender melhor as vias integradas do mecanismo de biocontrole. Uma biblioteca direcional de cDNA foi construída a partir do micélio de Trichoderma harzianum crescido em parede celular isolada de Fusarium solani. 3984 clones foram selecionados aleatoriamente, submetidos ao seqüenciamento da região 5 do vetor e identificados por similaridade contra a base de dados de seqüências de fungos GenBank. Dentre os 3984 clones, 40,8% mostraram similaridade com genes conhecidos e descritos na literatura. Análises dos genes identificados indicam similaridade com uma grande diversidade de genes que codificam para enzimas, proteínas estruturais e fatores de regulação. Uma proporção significante dos genes identificados está envolvida com processos relacionados ao icoparasitismo (3,81%), como esperado para um fungo envolvido no controle biológico. Estes resultados mostram uma aplicação bem sucedida da análise de ESTs na interação entre Trichoderma harzianum e Fusarium solani e dar uma sugetão da expressão gênica.por
dc.formatapplication/pdfpor
dc.identifier.citationSTEINDORFF, Andrei Stecca. Construction and analisys of a cDNA library of Trichoderma harzianum grown in presence of Fusarium solani cell wall. 2010. 71 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biolóicas) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2010.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tde/1239
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBRpor
dc.publisher.departmentCiências Biolóicaspor
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programMestrado em Biologiapor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.subjectTrichoderma harzianumpor
dc.subjectFusarium solanipor
dc.subjecttranscriptomapor
dc.subjectmicoparasitismopor
dc.subjectTrichoderma harzianumeng
dc.subjectFusarium solanieng
dc.subjecttranscriptomeeng
dc.subjectmicoparasitismeng
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICApor
dc.thumbnail.urlhttp://repositorio.bc.ufg.br/TEDE/retrieve/3895/dissertacao%20andrei.pdf.jpg*
dc.titleConstrução e análise de uma biblioteca de cDNA de Trichoderma harzianum crescido na presença de parede celular de Fusarium solanipor
dc.title.alternativeConstruction and analisys of a cDNA library of Trichoderma harzianum grown in presence of Fusarium solani cell walleng
dc.typeDissertaçãopor

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