Identificação de bactérias ambientais obtidas em amostras de água em comunidades quilombolas de Goiás

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dc.contributor.advisor-co1Bataus, Luiz Artur Mendes
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5637230378599476eng
dc.contributor.advisor1Carneiro, Lilian Carla
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/6506744224041777eng
dc.contributor.referee1Vieira, José Daniel Gonçalves
dc.contributor.referee2Santos, Mônica de Oliveira
dc.contributor.referee3Galvão Filho, Arlindo Rodrigues
dc.contributor.referee4Moreira, Ellen Flávia
dc.creatorGama, Aline Rodrigues
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/7601719790893656eng
dc.date.accessioned2020-04-06T10:33:25Z
dc.date.issued2020-03-17
dc.description.abstractWater quality has already been related to only aesthetic and sensory aspects, such as color, odor and taste. Today, in response to advances in understanding the relationship between contaminated water and disease, a series of regulations are proposed by the World Health Organization and the Ministry of Health that regulate the potability of water for human consumption. Based on studies and surveys on the way of life of two quilombola communities located in Aparecida de Goiânia and Silvânia, in the State of Goiás, the present work proposed the verification of the microbiological, physicochemical and toxicological quality of the water consumed by the residents of these communities. For the analyzes, samples of water from artesian wells and cisterns that supply the residences were collected and used for consumption in the Quilombola communities mentioned. A physical-chemical analysis was carried out by means of pH verification, alkalinity, hardness, physicality, turbidity, nitrate concentration and potentially toxic metals. The process of demonstration for a microbiological analysis began with the detection of coliforms followed by iso-regulation and phenotypic identification of isolated colonies, with the final recognition of two genera / species, which were subsequently submerged in the analysis of antibiotic resistance profile. The DNA of two bacterial isolates has been extracted and used for amplification and sequencing of the 16S rRNA gene. A comparison between the results obtained from the phenotypic identification and the ones based on the genomic sequence was carried out. In addition, at hyperspectral image (HSI) two isolates were obtained in camara SWIR, for classification, based on spectral signature. The results show that, as we have obtained, the Quilombola community of Aparecida de Goiânia has 16 bacterial isolates, considering that Klebsiella pneumoniae was more frequent (four isolates) with the collected points; followed by Escherichia coli (three isolated). As we have collected from the community of Silvânia, we show that there are no significant values for physicochemical analyzes and potentially toxic metals. The microbiological data showed 32 isolates, weaning, Acinetobacter lwoffii was a species more frequent (nine isolates), followed by Staphylococcus auricularis (seven isolates), with a large number of bacteria showing resistance to multiple antibiotics. Expressive were the differences generated between a phenotypic identification and genomic sequences; less than 20% two isolates achieved gender level agreement. It was possible, by means of HSI analyzes, to separate the bacterial isolates in different groups, and is not a group of isolates, in genus and species. Based on the technique used, there were no significant values for the physical-chemical and potentially toxic metal analyzes. Based on two observed results, it becomes important to perform actions, by the public power, that aim to improve water quality and in consequence of the life quality of people that live in studied communities. In addition, the use of appropriate methodologies for identifying environmentallybased bacteria, not being confidential or using phenotypic characteristics, is highlighted. Through the need for bacterial identification methodologies, it is considered that or use of HSI for this purpose, it will briefly be a common practice, for the construction of more robust data banks.eng
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dc.description.resumoA qualidade da água já esteve relacionada a apenas aspectos estéticos e sensoriais, tais como cor, odor e sabor. Hoje, em resposta aos avanços na compreensão da relação existente entre água contaminada e doenças, está proposta uma série de normatizações por parte da Organização Mundial da Saúde e Ministério da Saúde, que regulamentam os parâmetros de potabilidade da água própria para o consumo humano. A partir de estudos e levantamentos acerca do modo de vida de duas comunidades quilombolas localizadas em Aparecida de Goiânia e Silvânia, no estado de Goiás, o presente trabalho propôs a verificação da qualidade da água de consumo dessas comunidades e a análise dos métodos de identificação das bactérias isoladas. Para as análises foram realizadas coletas de amostras de água diretamente das torneiras que fornecem água utilizada para o consumo nas comunidades quilombolas supracitadas. O processamento das amostras para a análise microbiológica deu-se início com a detecção de coliformes seguido do isolamento e identificação fenotípica das colônias isoladas, com finalidade de reconhecimento dos gêneros/espécies que foram posteriormente submetidos a análise do perfil de resistência a antibióticos. O DNA dos isolados bacterianos foi extraído e utilizado para amplificação e sequenciamento do gene 16S rRNA. Uma comparação entre os resultados obtidos na identificação fenotípica e os baseados nas sequências genômicas foi realizado. Além disso, a imagem hiperespectral (HSI) dos isolados foi obtida em câmara SWIR para classificação baseada em assinatura espectral. A análise físico-química se deu por meio da verificação do pH, da alcalinidade, da dureza, da cor, da turbidez, da concentração de nitrato e metais potencialmente tóxicos. Os resultados demonstraram que as amostras obtidas da comunidade quilombola de Aparecida de Goiânia, apresentaram 16 isolados bacterianos, considerando que Klebsiella pneumoniae foi a mais frequente (quatro isolados) dentre os pontos coletados, seguida de Escherichia coli (três isolados). As amostras coletadas na comunidade de Silvânia, apresentaram 32 isolados, destes Acinetobacter lwoffii foi a espécie mais frequente (nove isolados), seguida de Staphylococcus auricularis (sete isolados), dentre os isolados um grande número de bactérias apresentaram resistência a múltiplos antibióticos. Expressivas foram as divergências geradas entre a identificação fenotípica e a baseada em sequências genômicas; menos de 20 % dos isolados obtiveram concordância em nível de gênero. Foi possível, por meio da análise das HSI, separar os isolados bacterianos em grupos distintos, isso no conjunto de isolados, a nível de gênero e de espécie. Com base na técnica utilizada, não houve valores significativos para as análises físico-químicas e de metais potencialmente tóxicos. A partir dos resultados aqui observados, torna-se importante a execução de ações, por parte do poder público, que visem a melhoria na qualidade da água e em consequência na qualidade de vida das pessoas que vivem nas comunidades estudadas. Além disso, ressaltamos aqui a importância do uso de metodologias adequadas de identificação de bactérias de origem ambiental, não sendo possível, para o mesmo, apenas o uso de características fenotípicas. Mediante a necessidade de metodologias de identificação bacteriana, consideramos que o uso de HSI para esse fim, será brevemente uma prática comum assim que bancos de dados mais robustos forem construídos.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESeng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationGAMA, A. R. Identificação de bactérias ambientais obtidas em amostras de água em comunidades quilombolas de Goiás. 2020. 150 f. Tese (Doutorado em Biologia da Relação Parasito-Hospedeiro) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2020.eng
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/10496
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentInstituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG)eng
dc.publisher.initialsUFGeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Biologia da Relação Parasito-Hospedeiro (IPTSP)eng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectQualidade da águapor
dc.subjectResistência antimicrobianapor
dc.subjectImagem hiperespectralpor
dc.subjectGene 16S rRNApor
dc.subjectSWIRpor
dc.subjectWater qualityeng
dc.subjectHyperspectral imagingeng
dc.subjectAntimicrobial resistanceeng
dc.subject16S rRNA Geneeng
dc.subjectSWIReng
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIAeng
dc.titleIdentificação de bactérias ambientais obtidas em amostras de água em comunidades quilombolas de Goiáseng
dc.title.alternativeIdentification of environmental bacteria obtained from water samples in quilombola communities in Goiáseng
dc.typeTeseeng

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