Determinação da estrutura terciária do peptídeo Cn-AMP1 isolado da água do coco verde, por Ressonância Magnética Nuclear (RMN)

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dc.contributor.advisor-co1Oliveira, Aline Lima de
dc.contributor.advisor1Lião, Luciano Morais
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2647529909397336por
dc.contributor.referee1Lião, Luciano Morais
dc.contributor.referee2Verly, Rodrigo Moreira
dc.contributor.referee3Franco, Octavio Luiz
dc.creatorSantana, Mábio João
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3146211681443372por
dc.date.accessioned2015-04-06T10:49:21Z
dc.date.issued2013-03-12
dc.description.abstractThis study aims to determine and analyze the three-dimensional structure in the lowest energy conformation of the peptide Cn-AMP1, isolated from green coconut water by 1H NMR. The determination of the 3D structure of the peptide under study was performed by homonuclear 2D 1H NMR experiments COSY, TOCSY and NOESY, using a 1 mM solution of the peptide Cn-AMP1 on Bruker AVANCE III 500 MHz (for 1H). The analysis of the correlation maps were made using the software NMRView, and the methodology adopted was the allocation sequence described by Wüthrich, where 200 structures were generated and selected the 20 lowest energy conformations to represent the overall three-dimensional structure Cn-AMP1 peptide. The peptide showed helical structure between residues Ser-1and Ala-6 in SDS- d25 micelles, 100 mM being structured randomly between residues Gln-7 and Met-9. However, under conditions of physiological pH, as in the absence of SDS micelles d25, the peptide showed no helix structure, predominating is randomly.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-03-27T16:12:44Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mábio João Santana - 2013.pdf: 6762200 bytes, checksum: b7132dc5dcb7ad5864728fd4aa01e879 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)eng
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-04-06T10:49:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mábio João Santana - 2013.pdf: 6762200 bytes, checksum: b7132dc5dcb7ad5864728fd4aa01e879 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2015-04-06T10:49:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mábio João Santana - 2013.pdf: 6762200 bytes, checksum: b7132dc5dcb7ad5864728fd4aa01e879 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-03-12eng
dc.description.resumoO presente trabalho tem como objetivo determinar e analisar a estrutura tridimensional em conformação de menor energia do peptídeo Cn-AMP1, isolado da água de coco verde por RMN de 1H. A determinação da estrutura 3D do peptídeo em estudo foi realizada através de experimentos de RMN de 1H homonuclear de COSY, TOCSY e NOESY, utilizando uma solução 1 mM do peptídeo Cn-AMP1, em espectrômetro BRUKER AVANCE III de 500 MHz, para o núcleo de hidrogênio. A análise dos mapas de correlação foram feitas usando o software NMRView, e a metodologia adotada foi a atribuição sequencial descrita por Wüthrich, onde foram geradas 200 estruturas e escolhidas as 20 conformações de menor energia global para representar a estrutura tridimensional do peptídeo Cn-AMP1. O peptídeo apresentou estruturação em hélice entre os resíduos Ser-1 e Ala-6, em micelas de SDS-d25, 100 mM, se estruturando randomicamente entre os resíduos Gln-7 e Met-9. No entanto, em condições de pH fisiológico, assim como na ausência de micelas de SDS-d25, o peptídeo não apresentou estrutura em hélice, prevalecendo a forma randômica.por
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationSANTANA, M. J. Determinação da estrutura terciária do peptídeo Cn-AMP1 isolado da água do coco verde, por Ressonância Magnética Nuclear (RMN). 2013. 104 f. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2013.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/4413
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentInstituto de Química - IQ (RG)por
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Química (IQ)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectPeptídeopor
dc.subjectEstrutura 3Dpor
dc.subjectSDS micelaspor
dc.subjectCocos nucíferapor
dc.subjectPeptideeng
dc.subject3D structureeng
dc.subjectSDS micelleseng
dc.subjectCocos nuciferaeng
dc.subject.cnpqQUIMICA::FISICO-QUIMICApor
dc.thumbnail.urlhttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/retrieve/18772/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20-%20M%c3%a1bio%20Jo%c3%a3o%20Santana%20-%202013.pdf.jpg*
dc.titleDeterminação da estrutura terciária do peptídeo Cn-AMP1 isolado da água do coco verde, por Ressonância Magnética Nuclear (RMN)por
dc.title.alternativeDetermining the tertiary structure of the peptide Cn-AMP1 isolated from coconut water by Nuclear Magnetic Resonance (NMR)eng
dc.typeDissertaçãopor

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