Análise do transcriptoma de Trichoderma harzianum em resposta a exposição a cádmio

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dc.contributor.advisor-co1Ulhoa, Cirano José
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8368469162867277eng
dc.contributor.advisor1Georg, Raphaela de Castro
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3971276154067590eng
dc.contributor.referee1Georg, Raphaela de Castro
dc.contributor.referee2Gomes, Suely Lopes
dc.contributor.referee3Bailão, Alexandre Melo
dc.contributor.referee4Ulhoa, Cirano José
dc.creatorOshiquiri, Letícia Harumi
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/1196093979638452eng
dc.date.accessioned2019-03-27T12:39:59Z
dc.date.issued2019-02-27
dc.description.abstractExcessive amounts of metals in soil can cause toxic effects to microorganisms, plants and animals. In contaminated regions, Trichoderma, a filamentous fungus capable of surviving in various environments, have already been isolated. The mechanisms involved in its metal tolerance are not yet fully understood, therefore, in order to evaluate Trichoderma harzianum response to cadmium, this report described the growth characteristics of the fungus and identified the gene expression profile at different concentrations of the metal, then using this data, searched for possible consensus sequences involved in its regulation. Of 13,932 genes predicted by the reference genome, 3,767 and 2,986 were differentially expressed when exposed to 1 mg.ml-1 and 2 mg.ml-1 of CdCl2, respectively. Of these genes, 2,562 were common to both treatments. Biological processes related to cellular homeostasis, transcription initiation, metabolic processes of sulfur compounds, RNA processing, protein modification and transport mediated by vesicles were up-regulated. It was observed that glutathione synthesis and its precursors’ pathways were up-regulated. Interestingly, various genes coding spliceosome components were identified. Carbohydrate, fatty acids and ionic transport metabolism were down-regulated, including important genes for the mycoparasitic potential of the fungus. Among the top down-regulated genes were genes of unknown function, therefore this analysis allowed an initial characterization of these genes. The main transcription factors related to the regulation of these genes were predicted as Cup2 (copper resistance), Cad1 (cadmium resistance) and Azf1-like (growth and proliferation). Together, the data obtained in this work suggests that the process of adaptation of T. harzianum to the presence of the metal cadmium involves the induction of several mechanisms of tolerance such as conjugation with glutathione, transport, compartmentalization in vacuoles, precipitation by sulfide, combat of ROS, DNA repair systems and quality control system for protein folding.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2019-03-27T12:17:51Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Letícia Harumi Oshiquiri - 2019.pdf: 3496808 bytes, checksum: 715264b6853d7601ebf1753723e63428 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
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dc.description.resumoO excesso de metais no solo pode causar efeitos tóxicos a microrganismos, plantas e animais. Em regiões contaminadas, já foram isoladas diferentes espécies de Trichoderma, um fungo filamentoso capaz de sobreviver em diversos ambientes. O seu mecanismo de tolerância aos metais ainda não é inteiramente compreendido, por isso, com o objetivo de avaliar a resposta de Trichoderma harzianum ao metal cádmio, este trabalho registrou suas características de crescimento na presença do metal e identificou seus perfis de expressão gênica em diferentes concentrações de cádmio, e, com os dados obtidos, buscou por prováveis sequências consenso envolvidas em sua regulação. Dos 13.932 genes preditos pelo genoma de referência, 3.767 e 2.986 apresentaram-se diferencialmente expressos nas condições de 1 mg.ml-1 e 2 mg.ml-1 de CdCl2, respectivamente. Destes genes, 2.562 foram comuns aos dois tratamentos. Processos biológicos relacionados à homeostase celular, início da transcrição, processos metabólicos de compostos de enxofre, processamento de RNA, modificação de proteínas e transporte mediado por vesículas foram regulados positivamente. Foi observado que a via de síntese de glutationa e do metabolismo de seus precursores foram induzidos. Interessantemente, foi identificada a indução de vários genes codificando proteínas componentes do spliceossomo. Metabolismo de carboidratos, de ácidos graxos e o transporte iônico foram reprimidos, incluindo genes importantes para a capacidade de micoparasitismo do fungo. Dentre os genes mais negativamente regulados pelas duas condições, vários não possuíam função conhecida, assim, a análise permitiu uma caracterização inicial destes genes. Os principais fatores de transcrição relacionados a regulação destes genes foram preditos como semelhantes a Cup2 (resistência ao cobre), Cad1 (resistência ao cádmio) e Azf1 (crescimento e proliferação). Em conjunto, os dados obtidos neste trabalho, indicam que o processo de adaptação de T. harzianum à presença do metal cádmio envolve a indução de diversos mecanismos de tolerância como conjugação com glutationa, transporte, compartimentalização em vacúolos, precipitação pelo sulfeto, combate as ROS, sistemas de reparo do DNA e sistema de controle de qualidade de enovelamento de proteínas.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESeng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationOSHIQUIRI, L. H. Análise do transcriptoma de Trichoderma harzianum em resposta a exposição a cádmio. 2019. 77 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2019.eng
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/9389
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicas - ICB (RG)eng
dc.publisher.initialsUFGeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ciências Biológicas (ICB)eng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectTrichoderma harzianumpor
dc.subjectRNA-Seqpor
dc.subjectCádmiopor
dc.subjectExpressão gênicapor
dc.subjectTrichoderma harzianumpor
dc.subjectRNA-Seqeng
dc.subjectCadmiumeng
dc.subjectMetalseng
dc.subjectGene expressioneng
dc.subjectMetaispor
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICAeng
dc.titleAnálise do transcriptoma de Trichoderma harzianum em resposta a exposição a cádmioeng
dc.title.alternativeTranscriptome analysis of Trichoderma harzianum in response to cadmium exposureeng
dc.typeDissertaçãoeng

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