Avaliação de métodos para estimativas de dissimilaridade em gradientes ecológicos com alta diversidade beta

Página do item simplificado
dc.contributor.advisor1Melo, Adriano Sanches
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/4602365265261727eng
dc.contributor.referee1Pereira, Rodrigo Augusto Santinelo
dc.contributor.referee2Diniz-Filho, José Alexandre Felizola
dc.creatorHoffmann, Júlio Cury
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/4369613274656187eng
dc.date.accessioned2018-07-04T12:29:08Z
dc.date.issued2018-04-18
dc.description.abstractThere are several problems on the analysis of biological communities with sparse data, resulting from gradients with high beta diversity. I used four strategies to solve this problem (Beals smoothing, Swan, Shortest Path and Extended Dissimilarity). I randomly removed from 1% to 50% of the individuals in empirical and simulated matrices. I then performed PCoA and nMDS ordinations and used Procrustes correlation of the original two dimensional ordination with the ordination obtained using the degraded matrices. For the simulated data set, I also correlated the ordenation in two dimensions with the coordinates of the samples in the two-dimensional simulated gradients. Finally, I analyzed how robustness to degradation, quantified as Procrustean correlation, was related to the matrix properties. Different from the expected, in the comparison of the degraded and original ordinations, the uncorrected data with a traditional dissimilarity index (Bray-Curtis) produced higher fit than the four methods evaluated. In relation to the coordinates of the simulated two-dimensional gradients, the evaluated methods were slightly better than the raw data. Overall, the simulated data were more robust to the degradation than the empirical ones and the data of abundance were more robust than matrices of presence and absence. Matrices with small proportion of zeros were more robust to degradation. I conclude that the correction methods evaluated distorted the pattern on the original data. Also, data with low beta diversity (few zeros) are robust to degradation and sufficient to reconstruct the original gradient.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2018-07-03T18:02:31Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Júlio Cury Hoffmann - 2018.pdf: 1219488 bytes, checksum: 20fea8e1513a899e8a9f32df5739d99a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-07-04T12:29:08Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Júlio Cury Hoffmann - 2018.pdf: 1219488 bytes, checksum: 20fea8e1513a899e8a9f32df5739d99a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2018-07-04T12:29:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Júlio Cury Hoffmann - 2018.pdf: 1219488 bytes, checksum: 20fea8e1513a899e8a9f32df5739d99a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-04-18eng
dc.description.resumoExistem vários problemas nas análises de comunidades em Ecologia decorrentes da grande quantidade de zeros na matriz de espécies por locais (dados esparsos), principalmente em situações em que a diversidade beta é alta. Usando quatro estratégias para resolver estes problemas (Beals, Swan, Menor Caminho e Dissimilaridade estendida) retirei aleatoriamente de 1 ate 50 % dos indivíduos de matrizes empíricas e simuladas (degradação das matizes). Realizei ordenações PCoA e nMDS e, com correlações de Procrustes, relacionei a ordenação original em duas dimensões com a ordenação obtida pelas matrizes degradadas. Com dados simulados relacionei a ordenação em duas dimensões também com as coordenadas das amostras no gradiente bidimensional simulado. Além disso, analisei como a robustez à degradação, medida como correlação Procrustes, está relacionada às características da matriz. Diferente do esperado, na comparação das ordenações de matrizes degradadas com a ordenação da matriz original, os dados utilizados sem correções e com índice de dissimilaridade tradicional (Bray-Curtis) tiveram maior ajuste que os quatro métodos avaliados. Em relação às coordenadas, os métodos aplicados tiveram desempenho um pouco melhor do que os dados sem correções quando a diversidade beta foi maior. Em geral, os dados simulados foram mais robustos à degradação que os empíricos e os dados de abundância foram mais robustos que de presença e ausência. Matrizes com menor proporção de zeros foram mais robustas à degradação. Concluo que os métodos de correção distorceram o padrão dos dados originais. Ainda, dados com baixa diversidade beta (poucos zeros na matrix) são robustos à degradação e são suficientes para reconstruir o gradiente original.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESeng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationHoffmann, J. C. Avaliação de métodos para estimativas de dissimilaridade em gradientes ecológicos com alta diversidade beta. 2018. 55 f. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Evolução) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2018.eng
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/8649
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicas - ICB (RG)eng
dc.publisher.initialsUFGeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ecologia e Evolução (ICB)eng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectEsforço amostralpor
dc.subjectCOMPASpor
dc.subjectCo-ocorrências de espéciespor
dc.subjectMétodos passo-a-frentepor
dc.subjectSampling efforteng
dc.subjectSpecies co-occurrenceeng
dc.subjectStep-across methodseng
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIAeng
dc.titleAvaliação de métodos para estimativas de dissimilaridade em gradientes ecológicos com alta diversidade betaeng
dc.title.alternativeAn evaluation of methods to estimate dissimilarity in ecological gradients with high beta diversityeng
dc.typeDissertaçãoeng

Arquivos

Pacote Original
Agora exibindo 1 - 1 de 1
Nenhuma Miniatura disponível
Nome:
Dissertação - Júlio Cury Hoffmann - 2018.pdf
Tamanho:
1.16 MB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descrição:
Baixar
Licença do Pacote
Agora exibindo 1 - 1 de 1
Nenhuma Miniatura disponível
Nome:
license.txt
Tamanho:
2.11 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descrição:
Baixar

Coleções

Mestrado em Ecologia e Evolução (ICB)