Detecção e análise de mutações de novo em pacientes com exposição parental à radiação ionizante de Césio-137 a partir de dados de genotipagem de polimorfismos de base única de alta densidade

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dc.contributor.advisor-co1Caetano, Alexandre Rodrigues
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8541586871435816pt_BR
dc.contributor.advisor1Silva, Cláudio Carlos da
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0277968514903258pt_BR
dc.contributor.referee1Silva, Cláudio Carlos da
dc.contributor.referee2Telles, Mariana Pires de Campos
dc.contributor.referee3Silva, Daniela de Melo e
dc.contributor.referee4Cruz, Alex Silva da
dc.contributor.referee5Gigonzac, Marc Alexandre Duarte
dc.creatorLeite Filho, Hugo Pereira
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/1670447499623486pt_BR
dc.date.accessioned2020-12-08T15:55:21Z
dc.date.available2020-12-08T15:55:21Z
dc.date.issued2020-10-28
dc.description.abstractIn 1987, in the city of Goiânia, a series of unexpected events resulted in a serious radiological accident, generated by Césio-137. The mutagenic effects of ionizing radiation (IR) can lead to accumulation of mutations in children of irradiated parents. It was established that chromosomal microarray analysis (CMA), a cytogenomic technique for the detection of SNP in a wide spectrum of regions of the human genome. The use of cytogenetic assays based on high-density microarray of DNA allows identifying variations in SNPs and, consequently, genotyping them. In this study, using the GeneChip® HD® assay it was possible to establish the genotypes of SNPs in a population born from progenitors exposed to cesium-137 ionizing radiation. Mendelian germline deviations were used to estimate the rate of mutations induced by parental exposure in their offspring. The exposed group consisted of 11 families, of which at least one parent was directly exposed to Cesium-137 ionizing radiation, including a total of 37 individuals (11 couples and 15 children born after the accident). The absorbed dose for exposed individuals ranged from 0.2 to 0.5 Gray. A group of individuals not exposed to ionizing radiation was used as a control. This group consisted of 15 families from Goiás with no history of exposure to IR. The statistical tests used were: Shapiro-Wilk test, F test, regression analysis, clustering, and the main component analysis. All analyses were performed using the statistical package R, with a significance level of 5% (p<0.05). FMDM frequencies were estimated by case and control, representing 1.3x10-3, 0.9x10-3, respectively. Thus, the frequencies of FMDM showed statistically significant differences between the exposed and control groups (p<2x10-3, α = 0.5, Student-t). The F test to compare the variations of two samples (Case and Control) from populations with normal distribution showed that the variations (F=4.47; α = 0.5, p<8x10-3) between cases and controls were significantly different. In addition, the progeny of a population accidentally exposed to low doses of IR showed ~ 1.44x more de novo Mendelian deviations (MD) than healthy controls. In conclusion, the frequency of germ line/generation MD mutation may be useful to study human populations exposed to IR retrospectively, using the Mendelian deviation findings technique, it was possible to identify the origin of the parents, as well as the type of substitution and inform which variant suffered the mutation. Therefore, DM are potentially useful markers to discriminate parental exposure to IR.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2020-12-07T13:22:16Z No. of bitstreams: 2 Tese - Hugo Pereira Leite Filho - 2020.pdf: 8464092 bytes, checksum: 0d1e44cbb2b58bdd8cfaa9afc0c51205 (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5)en
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dc.description.resumoEm 1987, na cidade de Goiânia, uma série de eventos inesperados resultou em um grave acidente radiológico, gerado pelo Césio-137. Os efeitos mutagênicos da radiação ionizante (RI) podem levar acúmulo de mutações em filhos de pais irradiados. Foi estabelecido que a análise cromossômica em microarranjos (CMA), uma técnica da citogenômica para a detecção de SNP em um amplo espectro de regiões do genoma humano. O uso de ensaios citogenômicos baseados em microarranjo de alta densidade de DNA permite identificar as variações em SNPs e, consequentemente, genotipá-los. No presente estudo, usando o ensaio do GeneChip® HD™ 750 K foi possível estabelecer os genótipos dos SNPs em uma população nascida de progenitores expostos à radiação ionizante de césio-137. Os desvios mendelianos da linha germinativa foram usados para se estimar a frequência de mutações induzidas pela exposição parental na sua prole. O grupo exposto foi constituído por 11 famílias, dos quais pelo menos um dos progenitores foi diretamente exposto à radiação ionizante de Césio-137, incluindo um total de 37 indivíduos (11 casais e 15 filhos nascidos após o acidente). A dose absorvida para os indivíduos expostos variou entre 0,2 a 0,5 Gray. Um grupo de indivíduos não-expostos à radiação ionizante foi usado como controle. Esse grupo foi composto por 15 famílias goianas sem histórico de exposição à RI. Os testes estatísticos utilizados foram: teste de Shapiro-Wilk, teste F, análise de regressão, clusterização e análise de componente princial. Todas as análises foram realizadas utilizando o pacote estatístico R, com nível de significância de 5% (p<0,05). As frequências de FMDM foram estimadas por caso e controle, representando 1,3x10-3, 0,9x10-3, respectivamente. Assim, as frequências de desvios mendelianos mostraram diferenças estatisticamente significativas entre os grupos expostos e controle (p<2x10-3, α = 0,5, Student-t). O teste F para comparar as variações de duas amostras (Caso e Controle) de populações com distribuição normal mostrou que as variações (F=4,47; α = 0,5, p<8x10-3) entre casos e controles foi significativamente diferente. Além disso, a progênie de uma população acidentalmente expostos a baixas doses de RI mostrou ~ 1.44x mais de desvios mendelianos (DM) de novo que controles saudáveis. Em conclusão, a frequência da mutação de linhagem germinativa/geração em DM poderá ser útil para estudar retrospectivamente populações humanas expostas à RI.pt_BR
dc.identifier.citationLEITE FILHO, H. P. Detecção e análise de mutações de novo em pacientes com exposição parental à radiação ionizante de Césio-137 a partir de dados de genotipagem de polimorfismos de base única de alta densidade. 2020. 139 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade em Rede Pró-Centro-Oeste) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2020.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/10960
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentPró-Reitoria de Pós-graduação (PRPG)pt_BR
dc.publisher.initialsUFGpt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Biotecnologia e Biodiversidade - Rede Pró-Centro-Oeste (PRPG/UnB)pt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectBioinformáticapor
dc.subjectSNPspor
dc.subjectGenotipagempor
dc.subjectDesvio Mendelianopor
dc.subjectCytoScan 750 Kpor
dc.subjectSNPseng
dc.subjectMendelian deviationeng
dc.subjectGenotypingeng
dc.subjectCytoScan 750Keng
dc.subjectBioinformaticseng
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICASpt_BR
dc.titleDetecção e análise de mutações de novo em pacientes com exposição parental à radiação ionizante de Césio-137 a partir de dados de genotipagem de polimorfismos de base única de alta densidadept_BR
dc.title.alternativeDetection and analysis of mutations de novo in patients with parental exposure to Cesium-137 ionizing radiation from genotyping data of high density single nucleotide polymorphismeng
dc.typeTesept_BR

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