Variabilidade e divergência genética de caracteres quantitativos e marcadores neutros em populações de Eugenia dysenterica DC

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dc.contributor.advisor-co1Telles, Mariana Pires de Campos
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/4648436798023532eng
dc.contributor.advisor1Chaves , Lázaro José
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/9990967290797379eng
dc.contributor.referee1Chaves, Lázaro José
dc.contributor.referee2Zucchi, Maria Imaculada
dc.contributor.referee3Grattapaglia, Dario
dc.contributor.referee4Coelho, Alexandre Siqueira Guedes
dc.contributor.referee5Ganga, Rita Maria Devós
dc.creatorNovaes, Carolina Ribeiro Diniz Boaventura
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/5640015140973531eng
dc.date.accessioned2019-07-16T12:35:34Z
dc.date.issued2014-10-16
dc.description.abstractGenotypic variations knowledge is an important tool that can point to the best approach for genetic resources maintenance, for both conservation and breeding purposes. To analyze and compare the phenotypic and genetic variation of wild subpopulations of Eugenia dysenterica DC., a fruity tree, 25 subpopulations were sampled in five states of the Brazilian Cerrado. Within each subpopulation, six trees were sampled and twenty fruits (maternal siblings) collected. Five fruits of each family were evaluated for morphometric variables of fruits and seeds. Twenty seeds of each family were randomly sown in each one of four blocks, five seeds per plot, established in a common garden experiment. Hierarchical model analysis of variance and variance components estimation were performed for fruit, seeds and early development traits and QST were estimated for early development traits. Four individuals per family were genotyped using nine microsatellite loci. Significant phenotypic and genotypic variations were observed both between subpopulations and between families within subpopulations. The highest proportion of the variance was found among families. Heritability estimates were 0.23 and 0.27 for growth rate and number of leaves and greater than 0.34 for other traits, indicating high potential for selective gain. Rapid early development is important for seedlings commercial production. Above ground biomass represented 15% of total biomass. Subpopulations are significantly structured for root length, height and diameter growth rates (QST 0.34, 0.23 and 0.20), but weak structure was establish for biomass and seedling emergence (QST <0.04). It has high genetic diversity, with average expected heterozigosity of 0.642. The mating system was mainly outcrossing (ta = 0.73), with high genetic differentiation between subpopulations (θP = 0.198), similar to previous studies. QST - FST contrasts were not significant for sixteen out of eighteen traits, suggesting genetic drift as the main source of phenotypic differentiation. Even though seedling emergence average time and root system fresh mass genetic similarity is granted to uniform selection. Quantitative and genetic distances clustered two distinct groups spatially structured, with respect to the Corumbá and São Bartolomeu river valley, in addition to the Chapada dos Veadeiros and Vão do Paranã region. Subpopulation 21 (Cocalinho-MT) quantitatively diverged from the two clusters. An in vivo collection of E. dysenterica was established for ex situ conservation. Genetic characterization and sampling extent suggest that the collection portrays well the cagaiteira’s wild population for selection purposes.eng
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dc.description.resumoConhecer as variações genotípicas presentes em populações constitui importante ferramenta para escolher a melhor conduta para o manejo de recursos genéticos, tanto para conservação quanto para o melhoramento. Com o objetivo de analisar e comparar a proporção da variação fenotípica e genética entre subpopulações naturais da árvore frutífera Eugenia dysenterica DC., foram amostradas 25 subpopulações em cinco estados do Cerrado brasileiro. Dentro de cada subpopulação, seis árvores foram amostradas e vinte frutos por matriz (irmãos maternos) coletados. Cinco frutos de cada matriz foram avaliados quanto a variáveis morfométricas de frutos e sementes. Vinte sementes de cada família foram semeadas ao acaso em quatro blocos, com cinco sementes por parcela, constituindo um teste de procedências e progênies. Foram realizadas a análise de variância e obtidas estimativas de seus componentes pelo modelo hierárquico, para caracteres de frutos, sementes e desenvolvimento inicial, além de estimativas de QST para caracteres de desenvolvimento inicial. Quatro indivíduos por família foram genotipados utilizando nove locos microssatélites. Variação fenotípica e genotípica significativa foi verificada entre subpopulações e entre famílias dentro de subpopulações, com a maior proporção verificada entre famílias. As estimativas de herdabilidade foram de 0,23 e 0,27 para taxa de crescimento e número de folhas e maior que 0,34 para os outros caracteres avaliados, que indicam bom potencial de seleção. A seleção de progênies com rápido desenvolvimento inicial é importante para a produção comercial de mudas. A biomassa alocada acima do solo representou 15% da biomassa total. As subpopulações estão significativamente estruturadas quanto ao comprimento da raiz, taxas de crescimento em altura e diâmetro (QST 0,34, 0,23 e 0,20), mas quanto à biomassa e emergência das plântulas estão fracamente estruturadas (QST < 0,04). O sistema de cruzamento é misto, com predominância de alogamia (ta=0,73), a diversidade genética elevada, com heterozigosidade média esperada de 0,642 e a diferenciação genética entre as subpopulações é alta (θP=0,198), semelhante ao encontrado em estudos anteriores. O contraste QST - FST foi não significativo para 16 dos 18 caracteres avaliados, o que indica prevalência da deriva genética como causa da diferenciação genotípica, embora para tempo médio de emergência das plântulas e massa verde do sistema radicular a similaridade genética possa ser explicada pela seleção uniforme. A subpopulação 21 (Cocalinho-MT) divergiu fenotipicamente mais das demais, que formam dois grupos distintos, inclusive pelas distâncias genéticas. Os dois grupos são estruturados espacialmente, cuja divisão geográfica corresponde ao vale dos rios Corumbá e São Bartolomeu, à Chapada dos Veadeiros e ao Vão do Paranã. Uma coleção in vivo de E. dysenterica para conservação ex situ foi estabelecida. A caracterização genética da coleção e a abrangência da coleta realizada sugerem que a amostragem foi adequada para iniciar um programa de seleção da espécie.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESeng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationNOVAES, Carolina Ribeiro Diniz Boaventura. Variabilidade e divergência genética de caracteres quantitativos e marcadores neutros em populações de Eugenia dysenterica DC. 2014. 223 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2014.eng
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/9835
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentEscola de Agronomia - EA (RG)eng
dc.publisher.initialsUFGeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EA)eng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectCagaiteirapor
dc.subjectConservação ex situpor
dc.subjectQSTpor
dc.subjectCerradopor
dc.subjectEx situ conservationeng
dc.subject.cnpqSILVICULTURA::GENETICA E MELHORAMENTO FLORESTALeng
dc.titleVariabilidade e divergência genética de caracteres quantitativos e marcadores neutros em populações de Eugenia dysenterica DCeng
dc.title.alternativeVariability and genetic divergence of quantitative traits and neutral markers for populations of Eugenia dysenterica DCeng
dc.typeTeseeng

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