Hibridização in situ por fluorescência: análise histórica, inovações e perspectivas

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dc.contributor.advisor-co1Pinto, Rafael Barbosa
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/9944641590654242pt_BR
dc.contributor.advisor1Soares, Thannya Nascimento
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5590256762396056pt_BR
dc.contributor.referee1Soares, Thannya Nascimento
dc.contributor.referee2Nunes, Rhewter
dc.contributor.referee3Machado, Raquel Moura
dc.creatorSilva, Thainá Ferreira
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/2916165224226158pt_BR
dc.date.accessioned2022-10-14T12:27:53Z
dc.date.available2022-10-14T12:27:53Z
dc.date.issued2022-09-05
dc.description.abstractFluorescence in situ hybridization (FISH) is a molecular cytogenetic technique that is based on the use of fluorescence-labeled probes to identify different regions in the genome. From the improvement and development of new technologies, variations of the original technique emerged making it possible to apply it to various issues, from identifying chromosomes through descriptive cytogenetics to making evolutionary inferences or conducting applied research in biotechnology and genetic improvement. Considering the great possibility of applications of the FISH technique and its variations, the present work aims to detail the methodological principles and applications, with emphasis on plants, and to investigate its use in evolutionary studies. For this, the first chapter is a manuscript for the dissemination and popularization of science that aims to discuss the various possibilities of using the FISH technique, ranging from its methodological principles to applications in different areas. From this study, it was verified that FISH can be applied to different biological materials and regions of the genome and, despite being a technique developed for more than three decades, it can generate impacts and contributions through its wide use until today. The second chapter is a systematic review, whose main objective is to summarize and critically analyze the data available in the literature on the applications of FISH for the cytogenetic study in plants, in addition to detailing and discussing the applications of this technique for evolutionary studies in plants. This study was conducted using the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guidelines. The search was carried out in the Scopus database and the keywords were directed to capture the breadth of the use of the FISH technique aimed at the cytogenetic study of plants. In order to investigate the applications of this technique, the articles found were grouped into different categories, called “Plant Biotechnology”, “Evolutionary Studies”, “Descriptive”, “Techniques/Methodological” and “Gene Expression”. A total of 4006 articles were selected that showed a trend of growth in the number of publications between the years 1975 - 2020. China and the USA concentrated the largest number of articles and Brazil was in 8th position. The analysis of the most used keywords in the articles made it possible to trace a small history of the technique, ranging from the beginning of indirect labeling in plant species, passing through the advances of FISH and its variations, to the use of oligo-synthetic probes today. The categories “Plant Biotechnology” and “Evolutionary Studies” represented more than 60% of the total works, with emphasis on the use of GISH and FISH techniques with repetitive DNA probes and indirect labeling. The Poaceae family stood out in the studies of "Plant Biotechnology" and Leguminosae and Asteraceae were mostly found in the category of "Evolutionary Studies", “Comparative analysis” and “Systems and cytotaxonomy.” Thus, the understanding of the technique, the synthesis and measurement of data and the evolutionary path elaborated in this study allowed the theoretical basis about the versatility of the technique and its use today. demonstrate the main contributions of FISH directed to studies with plants, highlighting the regions of research concentration, variations of the technique, main types of studies and botanical families, as well as contributing to answering different evolutionary questions.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Leandro Machado (leandromachado@ufg.br) on 2022-10-07T15:44:04Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thainá Ferreira Silva - 2022.pdf: 2830256 bytes, checksum: 6e987d556e88906b89fee8608d8afe17 (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5)en
dc.description.provenanceRejected by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com), reason: Observe como fez a citação no final: Dissertação (Programa Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2022. Encontrei no arquivo a seguinte informação: Capítulo 2 PANORAMA GERAL DA TÉCNICA FISH EM PLANTAS COM ÊNFASE ÀS QUESTÕES EVOLUTIVAS Manuscrito a ser submetido à publicação na revista BMC Perguntou para aluna se realmente podemos disponibilizar a dissertação, pois caso tenha intenção de submeter pode ter aceite negado por não ser inédito. on 2022-10-10T11:43:24Z (GMT)en
dc.description.provenanceSubmitted by Leandro Machado (leandromachado@ufg.br) on 2022-10-13T15:47:48Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thainá Ferreira Silva - 2022.pdf: 2830256 bytes, checksum: 6e987d556e88906b89fee8608d8afe17 (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5)en
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2022-10-14T12:27:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thainá Ferreira Silva - 2022.pdf: 2830256 bytes, checksum: 6e987d556e88906b89fee8608d8afe17 (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5)en
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dc.description.resumoA hibridização in situ por fluorescência (FISH) é uma técnica de citogenética molecular que se baseia no uso de sondas marcadas com fluorescência para a identificação de diferentes regiões no genoma. A partir do aperfeiçoamento e desenvolvimento de novas tecnologias, variações da técnica original surgiram tornando possível aplicá-la para diversas questões, desde identificar cromossomos através da citogenética descritiva até realizar inferências evolutivas ou conduzir pesquisas aplicadas de biotecnologia e melhoramento genético. Considerando a grande possibilidade de aplicações da técnica de FISH e suas variações, o presente trabalho tem como objetivo detalhar os princípios metodológicos e aplicações, com ênfase nas plantas, e investigar seu uso em estudos evolutivos. Para isso, o primeiro capítulo é um manuscrito de divulgação e popularização da ciência que tem como objetivo discutir as diversas possibilidades de uso da técnica FISH, abrangendo desde os seus princípios metodológicos até as aplicações em diferentes áreas. A partir desse estudo foi verificado que a FISH pode ser aplicada em diferentes materiais biológicos e regiões do genoma e, apesar de ser uma técnica desenvolvida há mais de três décadas, pode gerar impactos e contribuições através da sua vasta utilização até os dias de hoje. Já o segundo capítulo é uma revisão sistemática, cujo objetivo principal é sumarizar e analisar de forma crítica os dados disponíveis na literatura sobre as aplicações da FISH para o estudo citogenético em plantas, além de detalhar e discutir as aplicações dessa técnica para estudos evolutivos em plantas. Este estudo foi conduzido utilizando as diretrizes do Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA). A busca foi realizada na base de dados Scopus e as palavras-chave foram direcionadas para capturar a amplitude da utilização da técnica FISH voltada para o estudo citogenético das plantas. Com o objetivo de investigar as aplicações dessa técnica, os artigos encontrados foram agrupados em diferentes categorias, denominados como “Biotecnologia vegetal”, “Estudos evolutivos”, “Descritivo”, “Técnicas/metodológico” e “Expressão gênica”. Foram selecionados 4006 artigos que apresentaram uma tendência de crescimento de número de publicações entre os anos 1975 – 2020. A China e os EUA concentraram a maior quantidade de artigos e o Brasil se encontrou na 8ª posição. A análise das palavras-chave mais utilizadas nos artigos possibilitou traçar um pequeno histórico da técnica, abrangendo desde o início da marcação indireta em espécies dept_BR
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpt_BR
dc.identifier.citationSILVA, T. F. Hibridização in situ por fluorescência: análise histórica, inovações e perspectivas. 2022. 84 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2022.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/12368
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicas - ICB (RG)pt_BR
dc.publisher.initialsUFGpt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular (ICB)pt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectFISHpor
dc.subjectCitogenética molecularpor
dc.subjectGenética vegetalpor
dc.subjectRevisão sistemáticapor
dc.subjectFISHeng
dc.subjectMolecular cytogeneticseng
dc.subjectPlant geneticseng
dc.subjectSystematic revieweng
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICASpt_BR
dc.titleHibridização in situ por fluorescência: análise histórica, inovações e perspectivaspt_BR
dc.title.alternativeFluorescence in situ hybridization: historical analysis, innovations and perspectiveseng
dc.typeDissertaçãopt_BR

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