iSTATS: um software gratuito e interativo para estudos de caracterização estrutural e rotas metabólicas por RMN
| dc.contributor.advisor1 | Queiroz Junior, Luiz Henrique Keng | |
| dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/5071272851467384 | eng |
| dc.contributor.referee1 | Queiroz Junior, Luiz Henrique Keng | |
| dc.contributor.referee2 | Ferri, Pedro Henrique | |
| dc.contributor.referee3 | Colnago, Luiz Alberto | |
| dc.creator | Oliveira, Vitor Mendes de | |
| dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/1656853771964046 | eng |
| dc.date.accessioned | 2020-04-01T14:53:06Z | |
| dc.date.issued | 2020-02-13 | |
| dc.description.abstract | Resumo em língua estrangeira: This work aims to create software that helps users of the nuclear magnetic resonance technique to apply statistical techniques in a shorter time and without requiring prior knowledge of the programming language. The iSTATS software (interactive STAtisTical Spectroscopy) was developed in the R language using the resources available in the packages: textit shiny, shinyBS, shinyWidget, ggplot2, Cairo, plotly and Gtools. In iSTATS it is possible to import files with the extensions: textit .CSV, ASCII and .RData. When importing, the data matrix is constructed and pre-aligned, while on the graphical platform the spectral visualization section is presented with the tools: zoom, movements in the axis of chemical displacements and intensity. Another section is the selection of signs that has been shown to be practical and efficient in reducing the size of the matrix and in reducing the influence of noise and interfering signals, in addition to the possibility of exporting the selected regions in the form of points or integrated areas textit (Buckets). In iSTATS, 3 more sections were built, one for each variation of the textit STOCSY textit (Statistical TOtal Correlation SpectroscopY) method. The iSTATS tools were applied to the milk matrix made up of samples from various brands and regional producers, where, using the tools from the textit STOCSY-I section, was possible to identify correlations between signs of the same molecule as the signs of lactose and citrate , as well as between signals present in the same metabolic route. Applying the textit STOCSY-is tool on the matrix of omega 3 pills composed of samples from different brands, where it was possible to visually identify the difference between the animal and plant omega 3 terminal methyl signal, applying a form of statistical suppression in the signal region. Finally, it was possible via STOCSY-i to differentiate visually in the mixture of samples of the active substance ibuprofen and excipient without the use of the drug standard. | eng |
| dc.description.resumo | O presente trabalho tem como intuito a criação de um software que auxilie os usuários da técnica de ressonância magnética nuclear à aplicar técnicas estatísticas em um menor tempo e sem exigir conhecimento prévio de linguagem de programação. O software iSTATS (interactive STAtisTical Spectroscopy) foi desenvolvido na linguagem R utilizando os recursos disponíveis nos pacotes: shiny, shinyBS, shinyWidget, ggplot2, Cairo, plotly e Gtools. NoiSTATS é possível importar arquivos nas extensões: .CSV, ASCII e .RData. Aoimportar, a matriz de dados é construída e pré-alinhada, enquanto na plataforma gráfica é apresentada a seção de visualização espectral com as ferramentas: zoom, movimentações no eixo de deslocamentos químicos e de intensidade. Outra seção é a de seleção de sinais que se mostrou prática e eficiente na redução do tamanho da matriz e na diminuição da influência de ruídos e sinais interferentes, além de haver a possibilidade de exportar as regiões selecionadas em forma de pontos ou áreas integradas (Buckets). No iSTATS foram construídas mais 3 seções uma para cada variação do método STOCSY (Statistical TOtal Correlation SpectroscopY). As ferramentas do iSTATS foram aplicadas na matriz de leite composta de amostras de varias marcas e produtores regionais onde utilizando as ferramentas da seção STOCSY-I foi possível identificar correlações presentes entre sinais de uma mesma molécula como os sinais de lactose e citrato, bem como entre sinais presentes em uma mesma rota metabólica. Aplicando a ferramenta STOCSY-is na matriz de pilulas de ômega 3 composta de amostras de diferentes marcas, onde foi possível identificar visualmente a diferença entre o sinal da metila terminal de ômega 3 animal e vegetal, aplicando uma forma de supressão estatística na região do sinal. Por ultimo foi possível via STOCSY-I diferenciar visualmente na mistura de amostras do fármaco ibuprofeno principio ativo e excipiente sem o uso do padrão do fármaco. | eng |
| dc.description.sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES | eng |
| dc.format | application/pdf | * |
| dc.identifier.citation | OLIVEIRA, Vitor Mendes de. iSTATS: um software gratuito e interativo para estudos de caracterização estrutural e rotas metabólicas por RMN. 2020. 50 f. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2020. | eng |
| dc.identifier.uri | http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/10488 | |
| dc.language | por | eng |
| dc.publisher | Universidade Federal de Goiás | eng |
| dc.publisher.country | Brasil | eng |
| dc.publisher.department | Instituto de Química - IQ (RG) | eng |
| dc.publisher.initials | UFG | eng |
| dc.publisher.program | Programa de Pós-graduação em Química (IQ) | eng |
| dc.rights | Acesso Aberto | |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |
| dc.subject | STOCSY | por |
| dc.subject | RMN | por |
| dc.subject | Estatistica | por |
| dc.subject | Metabolômica | por |
| dc.subject | NMR | eng |
| dc.subject | Statistical | eng |
| dc.subject | Metabolomic | eng |
| dc.subject.cnpq | CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA | eng |
| dc.title | iSTATS: um software gratuito e interativo para estudos de caracterização estrutural e rotas metabólicas por RMN | eng |
| dc.title.alternative | iSTATS : a free and interactive software for structural characterization studies and metabolic path way by NMR | eng |
| dc.type | Dissertação | eng |
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