Effect of several structures of contemporary groups on estimates of (co)variance and genetic parameters for weaning weight in nellore cattle

Abstract

We used actual and adjusted weights to 120 d and 210 d of age of 72,731 male and female Nellore calves born in 40 PMGRN - Nellore Brazil herds from 1985 to 2005 aiming to compare the effect of different definitions of contemporary groups on estimates of (co)variance and genetic parameters. Four models, each one with a different structure of contemporary group (CG), were compared using the Akaike Information Criterion (AIC), the Bayesian Information Criterion (BIC), and the Consistent Akaike Information Criterion (CAIC). (Co)variance estimates were obtained using a derivative-free restricted maximum likelihood procedure. Estimates of (co)variances and genetic parameters were similar for the four models considered. However, the BIC and CAIC indicated that the most appropriate model for this Nellore population was the one that considered CG to be random, and sex of calf to be fixed and separate from CG, in which CG was defined as the group of calves born in the same herd, year, season of birth (trimester), and undergone the same management. _______________________________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT _______________________________________________________________________________________________________________________ Com o objetivo de se comparar o ajustamento de modelos com diferentes definições de grupos contemporâneos sobre as estimativas de (co)variâncias e parâmetros genéticos para pesos padronizados e reais aos 120 e 210 dias de idade, analisaram-se dados de 72.731 bezerros Nelore, machos e fêmeas, nascidos de 1985 a 2005 em 40 rebanhos integrantes do PMGRN - Nelore Brasil. Foram comparados quatro modelos incluindo diferentes estruturas de grupos contemporâneos (CG), julgados pelos critérios de informação de Akaike, Bayesiano e modificado de Akaike. As estimativas foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivadas. As estimativas de (co)variâncias e parâmetros genéticos foram similares entre os modelos, porém os critérios de informação (BIC, CAIC) indicaram que o modelo mais adequado é o que considera o grupo contemporâneo como efeito aleatório, sendo este constituído pela concatenação dos efeitos de rebanho, ano de nascimento, grupo de manejo e efeito sazonal de trimestre de nascimento, e com efeito do sexo do bezerro independente do CG.