Variabilidade genética e resistência de fungicidas em populações de Corynespora cassiicola provenientes de soja

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dc.contributor.advisor1Cunha, Marcos Gomes da
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2006008625763742pt_BR
dc.contributor.referee1Cunha, Marcos Gomes da
dc.contributor.referee2Coelho, Alexandre Siqueira Guedes
dc.contributor.referee3Lima, Milton Luiz da Paz
dc.creatorJesus, Jéssica Maria Israel de
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/8059585616093926pt_BR
dc.date.accessioned2021-11-23T12:55:10Z
dc.date.available2021-11-23T12:55:10Z
dc.date.issued2018-12-11
dc.description.abstractThe fungus Corynespora cassiicola (Berk. & M. A. Curtis) Wei belongs to the phylum Ascomycota and has been reported as a pathogen in more than 402 plant species. Among the hosts of C. cassiicola is the soybean of which is the causal agent of the target spot and root rot of Corynespora. The intensive use of fungicides to control diseases in soybean (mainly Asian rust) impacts populations of pathogens, and monitoring is necessary to detect the emergence of isolates resistant to the main fungicides. The efficient control of diseases depends on several factors, among them the correct identification and the knowledge about the genetic variability of the phytopathogen. The objective of this study was to: i) identify the isolates using molecular techniques and evaluate the genetic diversity of 203 C. cassiicola isolates obtained from soybean plants using molecular markers ISSR; ii) to determine the EC50 and EC98 of seven fungicides used in the control of Asian rust against "wild" isolates of C. cassiicola; iii) to evaluate (from EC50 and EC98) the sensitivity of C. cassiicola isolates collected from areas where systematic applications of fungicides for the control of Asian rust have been carried out; iv) to study the possible differences between C. cassiicola isolates from leaves and roots of soybean through the morphological and molecular characterization, genetic variability from ISSR molecular markers and cross pathogenicity between both groups of isolates; v) determine the EC50 and EC98 for the isolates from leaves and roots of soybean. All 203 leaf isolates with symptoms of target spot were identified as C. cassiicola. The genetic diversity of C. cassiicola was analyzed with nine ISSR primers, with 100% polymorphism. The Mantel test showed a positive correlation (r = 0.91) between the geographic distance and the genetic distance. Through AMOVA, it was possible to observe a medium structure for the state and high for the municipality of origin, suggesting gene flow among the populations of C. cassiicola from soybean crops. For the determination of the EC's 50 and 98, there was variation in sensitivity among the "wild" isolates of C. cassiicola, indicating an existing variability in this fungal species. The pathogen showed variability in sensitivity to the fungicidal groups triazoles (DMI) and strobilurins (QoI), which shows a high risk of selection for resistance. In the studies related to the differentiation between isolates from leaves and soybean root (target spot and Corynespora root rot), it was possible to observe great differentiation between both groups of isolates. In the molecular characterization there was a difference between the results of the primers specific for C. cassiicola (CCF-1 / CCR-1 and GA4F / GA4R) and also in the sequencing for the two genes (ITS and β-tubulin). The genetic diversity with ISSR primers obtained a percentage of polymorphism of 97.2%. The genetic dissimilarity values, calculated according to the complement of Dice index ranged from 0 to 0.797, reflecting a high genetic variability among the groups of C. cassiicola isolates. Through AMOVA, it was possible to observe a high structure between the two groups of isolates, referring to the plant tissue from which they come (root and leaf). The cross-pathogenicity test demonstrated the ability of the two groups of isolates to infect both plant tissues (leaf and root), but presenting differences in the speed and intensity of symptoms. In the evaluation of the sensitivity of the isolates to fungicides, it was possible to observe that the root sensitivity to fungicides, and the EC50 and EC98 doses estimated for this group were also lower than those determined for leaf isolates. From the results obtained in this study, it is possible to say that the two groups of isolates from soybean (leaf and root) do not belong to the same fungal species.eng
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dc.description.resumoO fungo Corynespora cassiicola (Berk. & M. A. Curtis) Wei, pertence ao filo Ascomycota e já foi relatado como patógeno em mais de 402 espécies de plantas. Dentre as hospedeiras de C. cassiicola está a soja da qual é o agente causal da mancha-alvo e da podridão radicular de Corynespora. O uso intensivo de fungicidas para o controle de doenças na soja (principalmente a ferrugem-asiática) impacta as populações de patógenos, sendo necessário o monitoramento para detectar o surgimento de isolados resistentes aos principais fungicidas. O controle eficiente de doenças depende de vários fatores, dentre eles da correta identificação e o conhecimento a respeito da variabilidade genética do fitopatógeno. Diante disso, com este estudo objetivou-se: i) identificar os isolados por meio de técnicas moleculares e avaliar a diversidade genética de 203 isolados de C. cassiicola obtidos de plantas de soja por meio de marcadores moleculares ISSR; ii) determinar as EC50 e EC98 de sete fungicidas empregados no controle da ferrugem-asiática, frente a isolados “selvagens” de C. cassiicola; iii) avaliar (a partir da EC50 e EC98) a sensibilidade de isolados de C. cassiicola coletados de áreas onde têm sido realizadas sistemáticas aplicações de fungicidas para o controle da ferrugemasiática; iv) estudar as possíveis diferenças existentes entre isolados de C. cassiicola provenientes de folhas e raízes de soja através da caracterização morfológica e molecular, variabilidade genética a partir de marcadores moleculares ISSR e patogenicidade cruzada entre ambos os grupos de isolados; v) determinar a EC50 e EC98 para os isolados provenientes de folhas e raízes de soja. Todos os 203 isolados de folhas com sintomas de mancha-alvo foram identificados como C. cassiicola. A diversidade genética de C. cassiicola foi analisada com nove primers ISSR, com 100% de polimorfismo. O teste de Mantel apresentou correlação positiva (r = 0,91) entre a distância geográfica e a distância genética. Por meio da AMOVA, foi possível observar uma estruturação média para estado e alta para município de origem, sugerindo fluxo gênico entre as populações de C. cassiicola provenientes de cultivos de soja. Para a determinação das EC’s 50 e 98, houve variação na sensibilidade entre os isolados “selvagens” de C. cassiicola, indicando uma variabilidade existente nessa espécie fúngica. O patógeno mostrou variabilidade na sensibilidade aos grupos fungicidas triazóis (DMI) e estrobilurinas (QoI), o que demonstra alto risco de seleção para resistência. Nos estudos relacionados com a diferenciação entre isolados provenientes de folhas e raiz de soja (mancha-alvo e podridão radicular de Corynespora) foi possível observar grande diferenciação entre ambos os grupos de isolados. Na caracterização molecular houve diferença entre os resultados dos primers específicos para C. cassiicola (CCF-1/CCR-1 e GA4F/GA4R) e também no sequenciamento para os dois genes (ITS e β-tubulina). A diversidade genética com primers ISSR obteve-se um percentual de polimorfismo de 97,2%. Os valores de dissimilaridade genética, calculados de acordo com o complemento do índice de Dice variaram de 0 a 0,797, refletindo uma variabilidade genética alta entre os grupos de isolados de C. cassiicola. Por meio da AMOVA, foi possível observar uma estruturação alta entre os dois grupos de isolados, referente ao tecido vegetal do qual são provenientes (raiz e folha). O teste patogenicidade cruzada demonstrou a capacidade dos dois grupos de isolados infectarem ambos os tecidos vegetais (folha e raiz), porém apresentando diferenças na velocidade e intensidade dos sintomas. Na avaliação de sensibilidade dos isolados a fungicidas, foi possível observar que os isolados de raiz apresentam maior sensibilidade a fungicidas, sendo que as doses EC50 e EC98, estimadas para esse grupo também foram menores que as determinadas para os isolados de folhas. A partir dos resultados obtidos nesse estudo, é possível dizer que os dois grupos de isolados provenientes de soja (folha e raiz) não pertencem à mesma espécie fúngica.pt_BR
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpt_BR
dc.identifier.citationJESUS, J. M. I. Variabilidade genética e resistência de fungicidas em populações de Corynespora cassiicola provenientes de soja. 2018. 179 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2018.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/11760
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentEscola de Agronomia - EA (RG)pt_BR
dc.publisher.initialsUFGpt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Agronomia (EA)pt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectMancha-alvopor
dc.subjectPodridão radicular de Corynesporapor
dc.subjectVariabilidade genéticapor
dc.subjectConcentração efetiva (EC50 e EC98)por
dc.subjectGenetic variabilityeng
dc.subjectSojapor
dc.subjectTarget Leaf Spoteng
dc.subjectSoybeaneng
dc.subjectCorynespora root roteng
dc.subjectEffective concentration (EC50 and EC98)eng
dc.subject.cnpqCIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIApt_BR
dc.titleVariabilidade genética e resistência de fungicidas em populações de Corynespora cassiicola provenientes de sojapt_BR
dc.title.alternativeGenetic variability and resistance to fungicides in Corynespora cassiicola populations from soybeaneng
dc.typeDissertaçãopt_BR

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