Mapeamento de locos de resistência ao crestamento bacteriano comum do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.)

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dc.contributor.advisor-co1Melo, Patrícia Guimarães Santos
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/1508679345970114eng
dc.contributor.advisor1Souza, Thiago Lívio Pessoa Oliveira de
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/9650183308779143eng
dc.contributor.referee1Souza, Thiago Lívio Pessoa Oliveira de
dc.contributor.referee2Vianello, Rosana Pereira
dc.contributor.referee3Sousa, Lorenna Lopes de
dc.contributor.referee4Melo, Patrícia Guimarães Santos
dc.creatorPassos, Ana Laura Pereira
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/4075449615115426eng
dc.date.accessioned2017-05-15T13:58:44Z
dc.date.issued2016-04-26
dc.description.abstractThe common bean (Phaseolus vulgaris) is grown in Brazil in various locations, soil and climatic conditions. The diseases are among the leading causes of losses in productivity of this legume, and the common bacterial blight (CBB) is the most important bacterioses that affects the culture. The resistance of CBB in common bean is a complex quantitative trait that results from the interaction of several genes. Genetic maps are tools that optimize the search for loci associated with this type of feature, and the most commonly used molecular markers available for this type of study are the SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). In this sense, this study aimed to: (i) develop a robust genetic map for common bean using SNP markers and the RIL (Recombinant Inbreed Lines) mapping population derived from Ruda × AND 277; (ii) characterize this RIL population and their parents about the reaction to common bacterial blight in field and greenhouse; and (iii) identifying genomic regions (major genes and/or QTL) that control the bacterial blight in this population. We used 393 individuals of the Ruda × AND 277 RIL population, evaluated for reaction to CBB in two field trials in Ponta Grossa - PR, in the rain growing season of 2012 and 2014 and in an inoculation test at the greenhouse, in Santo Antônio de Goiás - GO. The population was genotyped with 5,398 SNP markers and mapping was performed using the R-OneMap and MapDisto programs. Statistical analyzes were performed in the Genes program, and the Scott-Knott method was used for averages groupingin R platform. The QTL analysis was conducted in QTLCartographer program. Using the chi-square test (1:1), 2,062 markers were selected for mapping. Three genetic maps with high strengt, saturation and resolution were built. Statistical analysis showed that there is genetic variability for the CBB resistance in the population of RILs. The QTL analysis identified 10 QTLs linked to resistance of CBB in the Ruda × AND 277 RIL mapping population, in the chromosomes PV01, PV02, Pv07, Pv09 and PV11, based on results from evaluations carried out in the field and greenhouse. The maps constructed for this population have high strength and resolution and may be used for future work on integrative mapping. The statistical analysis evidenced the quantitative character of resistance to CBB in common bean and showed that the parent Rudá has the CBB resistance alleles. It is expected that the markers linked to these QTLs identified can be used in future studies of marker assisted selection.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:58:20Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Laura Pereira Passos - 2016.pdf: 6140952 bytes, checksum: 715de51ee1d8b3b7ffd295f5d7121216 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
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dc.description.resumoO feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris) é cultivado no Brasil em vários locais e diversas condições edafoclimáticas. As doenças estão entre as principais causas de prejuízos na produtividade dessa leguminosa, sendo o crestamento bacteriano comum (CBC) a principal bacteriose que afeta essa cultura. A resistência ao CBC no feijoeiro-comum é uma característica complexa, quantitativa, que resulta da interação de vários genes. Os mapas Genéticos são ferramentas que otimizam a busca de locos associados a esse tipo de característica, e os marcadores moleculares mais utilizados disponíveis para esse tipo de estudo são os SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). Neste sentido, o presente trabalho teve como objetivos: (i) construir um mapa genético robusto para o feijoeiro-comum, utilizando marcadores SNP e a população de RILs (Recombinant Inbred Lines, ou linhagens endogâmicas recombinantes) derivada do cruzamento Rudá × AND 277; (ii) caracterizar esta população de RILs e seus genitores quanto à reação ao crestamento bacteriano comum, em campo e em casa de vegetação; e (iii) identificar regiões genômicas (genes de efeito principal e/ou QTLs) que controlam a reação ao crestamento bacteriano comum nesta população. Foram utilizados 393 indivíduos da população de RILs Rudá × AND 277, avaliados quanto à reação ao CBC em dois ensaios de campo em Ponta Grossa – PR, nas águas de 2012 e 2014, e em um ensaio de inoculação em casa de vegetação, em Santo Antônio de Goiás - GO. A população foi genotipada com 5.398 marcadores SNP e o mapeamento das RILs foi realizado utilizando os programas R-OneMap e MapDisto. As análises estatísticas foram realizadas no programa Genes, sendo o agrupamento de médias de Scott-knott realizado na plataforma R. A análise de QTL foi realizada no programa QTLCartographer. Por meio do teste de quiquadrado (1:1) foram selecionados 2.062 marcadores para o mapeamento. Foram construídos três mapas genéticos com elevada robustez, saturação e resolução. As análises estatísticas evidenciaram que há variabilidade genética para a característica de resistência ao CBC na população de RILs. A análise de QTL identificou 10 QTLs ligados à resistência ao CBC na população de RILs Rudá × AND 277 nos cromossomos Pv01, Pv02, Pv07, Pv09 e PV11 com base em dados obtidos a partir de avaliações em campo e casa de vegetação. Os mapas construídos para essa população apresentam elevada robustez e resolução e poderão ser utilizados para futuros trabalhos de mapeamento integrativo. As análises estatísticas evidenciaram o caráter quantitativo da resistência ao CBC em feijoeiro-comum e mostraram que o genitor Rudá possui alelos de resistência ao CBC. Espera-se que os marcadores ligados a esses QTLs identificados possam ser utilizados em futuros trabalhos de seleção assistida por marcadores.eng
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEGeng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationPASSOS, A. L. P. Mapeamento de locos de resistência ao crestamento bacteriano comum do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.). 2016. 78 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2016.eng
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/7319
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentEscola de Agronomia e Engenharia de Alimentos - EAEA (RG)eng
dc.publisher.initialsUFGeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EAEA)eng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectMapeamento genéticopor
dc.subjectmarcadores molecularespor
dc.subjectXanthomonas axonopodispor
dc.subjectLinhagens endogâmicas recombinantespor
dc.subjectMarcadores SNPpor
dc.subjectFeijoeiro-comumpor
dc.subjectGenetic mappingeng
dc.subjectMolecular markerseng
dc.subjectXanthomonas axonopodiseng
dc.subjectRecombinant inbred lineseng
dc.subjectSNP markerseng
dc.subjectCommon beaneng
dc.subject.cnpqCIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIAeng
dc.titleMapeamento de locos de resistência ao crestamento bacteriano comum do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.)eng
dc.title.alternativeGenetic mapping of common bacterial blight resistance loci in common bean (Phaseolus vulgaris L.)eng
dc.typeDissertaçãoeng

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