SNPs e microssatélites na caracterização racial e de resistência a enfermidades em bovinos da raça Curraleiro Pé-Duro

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dc.contributor.advisor-co1Carmo, Adriana Santana do
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0782572407995106eng
dc.contributor.advisor-co2Moura, Maria Ivete de
dc.contributor.advisor-co2Latteshttp://lattes.cnpq.br/9636259477810298eng
dc.contributor.advisor1Fioravanti, Maria Clorinda Soares
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8772502020076257eng
dc.contributor.referee1Fioravanti, Maria Clorinda Soares
dc.contributor.referee2Landi, Vincenzo
dc.contributor.referee3Cruz, Aparecido Divino da
dc.contributor.referee4Jayme, Valéria de Sá
dc.contributor.referee5Badr, Kareem Rady
dc.creatorFreitas, Thais Miranda Silva
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/0090877254263290eng
dc.date.accessioned2019-07-16T14:54:32Z
dc.date.issued2018-12-05
dc.description.abstractThe Brazilian cattle breed Curraleiro Pé-Duro is an important genetic resource that has as characteristics of rusticity, adaptability to environmental conditions, and resistance to diseases and intoxications. This study aims to analyze the genetic diversity of Curraleiro Pé-Duro populations and verify the presence of SNPs and microsatellite polymorphisms for breed characterization and disease resistanceto Brucella abortus, Leptospira spp, Neospora caninum, leukosis virus, Infectious Bovine Rhinotracheitis, and Bovine Viral Diarrhea. A total of 1.182 serum and blood samples of Curraleiro Pé-Duro breed belonging to the Pro-Centro-Oeste Network database were used. Amplification and genotyping of 28 microsatellite markers of breed characterization and 13 markers related to the bovine leukocyte antigen (BoLA) and SLC11A genes were used. Twenty-four single-base polymorphisms (SNPs), detected by Kompetitive Allele-Specific PCR, were investigated in genes related to cytokines expression. Univariate analysis was performed for the association of genotypes with phenotypes, followed by logistic regression considering a significance level of 5%. Bayesian analysis grouped the animals into three breed clusters, indicating the presence of subpopulation, with similar prevalence for infections. Heterozygosity and Fst values indicated little differentiation between clusters and increased homozygosity. On BoLA gene, 42 allels associated to infections were identified. SNP haplotypes in BTA6 and BTA15 were significant in seronegative animals while BTA17 haplotype 2 was presented in 70% of Neospora caninum positive animals. The results showed that Curraleiro Pé-Duro cattle breed has alleles of resistance to infections that can be lost due to loss of genetic diversity.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2019-07-16T14:38:15Z No. of bitstreams: 2 Tese - Thais Miranda Silva Freitas - 2018.pdf: 2938540 bytes, checksum: 7ecadca6dd591c3ec008d6603da63795 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
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dc.description.resumoA raça bovina local brasileira Curraleiro Pé-Duro é patrimônio genético que tem como características rusticidade, adaptabilidade às condições ambientais e resistência a doenças e intoxicações. Objetivou-se com este estudo observar a variabilidade genética em populações da raça, verificando a ocorrência de marcadores SNP e microssatélites para caracterização racial e resistência a infeções por Brucella abortus, Leptospira spp, Neospora caninum, e pelos vírus da leucose, rinotraqueite infecciosa e diarreia viral bovina. Foram usadas 1.182 amostras de bovinos pertencentes ao banco de dados da Rede Pró-Centro-Oeste. Foi realizada amplificação e genotipagem de 28 marcadores microssatélites de caracterização racial e 13 relacionados aos genes do complexo antígeno leucocitário bovino (BoLA). Foram investigados 24 polimorfismos de base única (SNP) em genes relacionados à expressão de citocinas por meio da técnica Kompetitive Allele-Specific PCR. Os genótipos foram associados aos fenótipos por análise univariada, seguida de regressão logística, considerando nível de significância de 5%. A análise Bayesiana agrupou os animais em três clusters raciais, indicando a presença de subpopulação, com similar prevalência das infecções. As heterozigosidades e os valores de FST, FIT e FIS indicaram pouca diferenciação entre os clusters e homozigosidade aumentada. Foram identificados 42 alelos no gene BoLA associados às infecções. Os haplótipos SNPs no BTA6 e BTA15 foram mais frequentes em animais soronegativos enquanto o haplótipo 2 do BTA17 esteve presente em 70% dos animais positivos contra Neospora caninum. A raça Curraleiro Pé-Duro possui alelos de resistência a infecções que podem se perder devido à perda da diversidade genética da raça.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESeng
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPqeng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationFREITAS, T. M. S. SNPs e microssatélites na caracterização racial e de resistência a enfermidades em bovinos da raça Curraleiro Pé-Duro. 2018. 102 f. Tese (Doutorado em Ciência Animal) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2018.eng
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/9838
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentEscola de Veterinária e Zootecnia - EVZ (RG)eng
dc.publisher.initialsUFGeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ciência Animal (EVZ)eng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectGene BoLApor
dc.subjectMarcadores molecularespor
dc.subjectRaça local brasileirapor
dc.subjectBoLA geneeng
dc.subjectBrazilian cattle breedeng
dc.subjectMolecular markerseng
dc.subject.cnpqCIENCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS::TECNOLOGIA DE ALIMENTOSeng
dc.titleSNPs e microssatélites na caracterização racial e de resistência a enfermidades em bovinos da raça Curraleiro Pé-Duroeng
dc.title.alternativeSNPs and microssatellites in the genetic characterization and diseases resistance of Curraleiro Pé-Duro bovine breedeng
dc.typeTeseeng

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