Caracterização fenotípica e molecular de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans procedentes de regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasil

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dc.contributor.advisor-co1Wendland, Adriane
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/7196405181790361por
dc.contributor.advisor1Araújo, Leila Garcês de
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3488880262260757por
dc.contributor.referee1Araújo, Leila Garcês de
dc.contributor.referee2Borba, Tereza Cristina de Oliveira
dc.contributor.referee3Coelho, Gesimária Ribeiro Costa
dc.contributor.referee4Wendland, Adriane
dc.creatorPaiva, Bruna Alicia Rafael de
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/0810327551529910por
dc.date.accessioned2017-04-18T13:34:11Z
dc.date.issued2014-02-25
dc.description.abstractThe Common bacterial blight caused by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) and Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), is one of most important bacterial etiology diseases from the common bean plant. This pathogen causes a great loss in the production, mainly in the “water” harvest, when the environmental conditions are helpful to the development of this disease and to its dissemination. Among the strategies about integrated handling of diseases, the genetic resistance is the main measure of control and, for obtaining some cultivate with lasting resistance and of notorious specter, it is important to the know the genetic pathogen diversity. The present work has the goal of studying the diversity and the genetic structure around and inside the population of Xap and Xff using the markers rep-PCR; to connect the genetic pathogen diversity with its geographical distribution inside Brazilian producing common bean plant regions. There were obtained 42 Xap and Xff isolated and four Xanthomonas isolated not pathogens of to the bean plant, originated in the States of São Paulo, Goiás, Paraná and Rio Grande do Sul. The genetic profiles obtained by primers BOX, ERIC and REP produced 12 haplotipes matched (HC), where the HC 3, specific xff, was more frequent in PR and GO, and was not found in RS. The dendrogram produced through the analysis showed that Xap, Xff and isolated not pathogens are genetically different. In the analysis of genetic structure, the total genetic diversity (Ht), among three populations was 0,2385 revealing that there was variability from a population to the other one. Higher values of the Shannon rate (0,3648) show that Xap population is more different genetically. From a total of 51 locos, 94,12 % are polymorphic, inside Xap population they are all polymorphicand inside Xff, only 18,18 % are polymorphic. The genetic differentiation coefficient (Gst = 0,5194) revealed diversity inside and among the patogenic populations, confirming AMOVA’s result, where 51,98 % of the diversity was among the populations and 48,06 % inside them. Then, the technique helped how to find differences between Xap and Xff and measure the values of genetic diversity among and inside populations. The results of this study give us much information about the pathogens diversity, which is considered useful to identify and to characterize the resistant germoplasm in a more efficient way.eng
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dc.description.resumoO crestamento bacteriano comum, causado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), é uma das doenças de etiologia bacteriana mais importantes do feijoeiro-comum. Este patógeno provoca grandes perdas na produção, principalmente na safra das “águas”, quando as condições ambientais são favoráveis ao desenvolvimento da doença e à disseminação do patógeno. Dentro das estratégias do manejo integrado de doenças, a resistência genética é a principal medida de controle, e para a obtenção de cultivares com resistência duradoura e de amplo espectro é necessário o conhecimento da diversidade genética do patógeno. O presente trabalho teve como objetivos, estudar a diversidade e a estrutura genética entre e dentro das populações de Xap e Xff usando marcadores rep-PCR; relacionar a diversidade genética do patógeno com sua distribuição geográfica dentro das regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasil. Foram obtidos 42 isolados de Xap e Xff, e quatro isolados de Xanthomonas não patogênicas ao feijoeiro, oriundos dos estados de São Paulo, Goiás, Paraná e Rio Grande do Sul. Os perfis genéticos obtidos pelos primers BOX, ERIC e REP geraram 12 haplótipos combinados (HC), em que o HC 3, específico de Xff, foi mais frequente nos estados do PR e GO , porém não foi identificado no RS. O dendrograma gerado através da análise conjunta mostrou que Xap, Xff e isolados não patogênicos foram geneticamente distintos. Na análise de estruturação genética, a diversidade genética total (Ht) entre as populações foi de 0,2385, mostrando que houve variabilidade entre as populações. Valores mais altos do índice de Shannon (0,3648) revelam que a população de Xap é mais diversa geneticamente. De um total de 51 locos em todas populações, 94,12% foram polimórficos, sendo que, dentro de Xap todos foram polimórficos, e dentro de Xff apenas 18,18% foram polimórficos. O coeficiente de diferenciação genética (GST = 0,5194) revelou diversidade tanto dentro como entre as populações patogênicas, confirmando o resultado obtido pela AMOVA, em que 51,98% da diversidade está distribuída entre as populações e 48,06% dentro destas. Portanto, o uso da técnica rep-PCR permitiu diferenciar Xap e Xff e mensurar os valores de diversidade genética entre e dentro de populações. Os resultados deste estudo fornecem informações sobre a diversidade dos patógenos, o que auxiliará para melhor identificar e caracterizar o germoplasma resistente.por
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationPAIVA, B. A. R. Caracterização fenotípica e molecular de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans procedentes de regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasil. 2014. 67 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2014.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/7162
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentEscola de Agronomia e Engenharia de Alimentos - EAEA (RG)por
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EAEA)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectPhaseolus vulgarispor
dc.subjectCrestamento bacteriano comumpor
dc.subjectDiversidade genéticapor
dc.subjectPhaseolus vulgariseng
dc.subjectCommon bacterial blighteng
dc.subjectrep-PCReng
dc.subjectGenetic diversityeng
dc.subjectrep- PCRpor
dc.subject.cnpqFITOTECNIA::FISIOLOGIA DE PLANTAS CULTIVADASpor
dc.titleCaracterização fenotípica e molecular de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans procedentes de regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasilpor
dc.title.alternativePhenotypic and molecular characterization of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli and Xanthomonas fuscans subps. fuscans coming of producing regions of common bean plant in Brazileng
dc.typeDissertaçãopor

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