Identificação de novos fármacos antimaláricos através de estratégia de quimiogenômica por reposicionamento e validação experimental
dc.contributor.advisor-co1 | Cravo, Pedro Vitor Lemos | |
dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/1059199347781390 | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Andrade, Carolina Horta | |
dc.contributor.referee1 | Andrade, Carolina Horta | |
dc.contributor.referee2 | Andrade, Éverton Kort Kamp | |
dc.contributor.referee3 | Castro, Ana Maria | |
dc.contributor.referee4 | Neves, Bruno Júnior | |
dc.contributor.referee5 | Costa, Fabio Trindade Maranhão | |
dc.creator | Rodrigues, Juliana | |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/0159522060861544 | pt_BR |
dc.date.accessioned | 2020-12-02T14:29:28Z | |
dc.date.available | 2020-12-02T14:29:28Z | |
dc.date.issued | 2018-03-05 | |
dc.description.abstract | Malaria is an infectious disease of possible chronic evolution that affects billions of people in the tropics and subtropics. P. falciparum is the most lethal malaria parasite of humans, while P. vivax is the most widely distributed. The effectiveness of the antimalarial treatment is compromised by the ability of the parasite to evolve resistance to the compounds and by the lack of new effective antimalarials, underscoring the urgent need for the discovery of new drugs. One of the strategies that has been gradually explored in the search for new therapies is the so-called "drug repurposing" approach. In this context, the goal of the present study was to use a drug repurposing-chemogenomics strategy to identify effective drugs against malaria parasites. A comparative genomics tool available from the TDR Targets Database was used through to select targets expected to be present exclusively in P. falciparum and P. vivax parasites, but absent in humans. Each of the selected targets was then used as a query in the following databases: Drugbank, Therapeutic Target Database and STITCH. The P. falciparum and P. vivax targets were aligned with their predicted homologue targets, using pairwise BLAST, to compare functionally relevant regions. Only those where ≥ 80% overlap was observed between the two sequences for the corresponding drug target were considered for subsequent studies. Thereafter, the drugs identified were submitted to a bibliographic search to find drugs that were never evaluated against malaria parasites in the past. A prediction of active compounds was performed through binary QSAR models. The selected drugs were submitted to in vitro assays using asexual stages of P. falciparum (strains 3D7, chloroquine-sensitive, and W2, multidrug-resistant). Epirubicin displayed potent in vitro activity against the 3D7 strain (IC50 = 140 nM). In addition, the drug was shown to be about twice as active against the W2 resistant strain (IC50 = 69 nM), exhibiting even greater activity than chloroquine. At present, in vitro experiments in sexual stages (ookinete conversion) and in vivo assays with P. berghei and P. chabaudi are being carried out. In conclusion, epirubicin is a good antimalarial drug candidate, although future studies are required to investigate its mechanism of action, potential toxicity, and eventually, to advance in the drug development process. | eng |
dc.description.provenance | Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2020-12-02T04:43:17Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5) Tese - Juliana Rodrigues - 2020.pdf: 3942943 bytes, checksum: 9abb49f43b38daa35d72252f04c3d173 (MD5) | en |
dc.description.provenance | Rejected by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com), reason: Ao renomear o arquivo não é o ano que recebemos o arquivo que se coloca, mas o que consta na folha-de-rosto, apesar de não conter essa informação no Guia (já passei isso para Jaqueline) on 2020-12-02T11:21:37Z (GMT) | en |
dc.description.provenance | Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2020-12-02T14:16:26Z No. of bitstreams: 2 Tese - Juliana Rodrigues - 2018.pdf: 3942943 bytes, checksum: 9abb49f43b38daa35d72252f04c3d173 (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5) | en |
dc.description.provenance | Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2020-12-02T14:29:28Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Juliana Rodrigues - 2018.pdf: 3942943 bytes, checksum: 9abb49f43b38daa35d72252f04c3d173 (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5) | en |
dc.description.provenance | Made available in DSpace on 2020-12-02T14:29:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Juliana Rodrigues - 2018.pdf: 3942943 bytes, checksum: 9abb49f43b38daa35d72252f04c3d173 (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5) Previous issue date: 2018-03-05 | en |
dc.description.resumo | A malária é uma doença infecciosa grave que acomete bilhões de pessoas em todo o mundo. Plasmodium falciparum é o agente causador de malária grave em humanos, enquanto que P. vivax é o mais amplamente distribuído, sendo a principal espécie causadora de malária no Brasil. Atualmente, seu controle é baseado principalmente em equemas terapêuticos. No entanto, a eficácia do tratamento é comprometida pela resistência do parasito a todos os fármacos disponíveis, inclusive à artemisinina. Existe, portanto, uma necessidade urgente da descoberta de novos fármacos antimaláricos. O reposicionamento de fármacos é uma importante estratégia para acelerar a descoberta de fármacos, pois visa a identificação de novos usos para fármacos já aprovados. Assim, o objetivo deste trabalho foi utilizar uma estratégia de reposicionamento de fármacos por quimiogenômica, com foco em P. falciparum e P. vivax, a fim de identificar fármacos já aprovados que sejam eficazes contra parasitos de malária. Inicialmente, realizou-se uma aproximação de genômica comparativa na base de dados da TDR Targets Database para selecionar alvos presentes exclusivamente em P. falciparum e P. vivax, mas sem homólogos em humanos. Cada um dos alvos selecionados foi então usado para interrogar as bases de dados de fármacos, DrugBank, Therapeutic Target Database e STITCH. Os alvos de P. falciparum e P. vivax foram alinhados com os seus alvos homólogos utilizando o BLAST. Foram considerados para estudos subsequentes apenas os que apresentaram ≥ 80% de sobreposição entre as duas sequências para o alvo do fármaco correspondente. Assim, os fármacos identificados foram submetidos a uma busca na literatura visando selecionar fármacos que nunca foram testados experimentalmente contra parasitos de malária. Em seguida, foi realizada uma predição da atividade dos fármacos selecionados, utilizando modelos de QSAR binários desenvolvidos em nosso laboratório. Ao final, a estratégia de quimiogenômica permitiu selecionar seis fármacos com potencial atividade antimalárica. Estes fármacos foram submetidos a ensaios in vitro em estágios assexuados de P. falciparum (cepas 3D7, sensível a cloroquina, e W2, multi-resistente). Dentre eles, a epirrubicina se destacou por exibir uma potente atividade in vitro contra a cepa 3D7 (IC50 = 140 nM). Além disso, este fármaco demonstrou ser cerca de duas vezes mais ativa contra cepas resistentes W2 (IC50 = 69 nM), exibindo, inclusive, maior atividade do que a cloroquina. No momento, experimentos in vitro em estágios sexuados (conversão de oocineto) e ensaios in vivo com P. berghei e P. chabaudi estão sendo realizados. A epirrubicina se mostrou, portanto, um candidato interessante a fármaco antimalárico. Futuros estudos são necessários para investigar o seu mecanismo de ação e potencial toxicidade e, eventualmente, avançar no processo de desenvolvimento do fármaco. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq | pt_BR |
dc.identifier.citation | RODRIGUES, J. Identificação de novos fármacos antimaláricos através de estratégia de quimiogenômica por reposicionamento e validação experimental. 2018. 167 f. Tese (Doutorado em Medicina Tropical e Saúde Publica) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2018. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/10952 | |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal de Goiás | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.publisher.department | Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG) | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFG | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-graduação em Medicina Tropical e Saúde Publica (IPTSP) | pt_BR |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | * |
dc.subject | Malária | por |
dc.subject | Tratamento | por |
dc.subject | Resposicionamento de fármacos | por |
dc.subject | Quimiogenômica | por |
dc.subject | Epirrubicina | por |
dc.subject | Malaria | eng |
dc.subject | Treatment | eng |
dc.subject | Drug repositioning | eng |
dc.subject | Chemogenomics | eng |
dc.subject | Epirubicin | eng |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS DA SAUDE | pt_BR |
dc.title | Identificação de novos fármacos antimaláricos através de estratégia de quimiogenômica por reposicionamento e validação experimental | pt_BR |
dc.title.alternative | Identification of new antimalarial drugs through drug repositioning chemogenomics approach and experimental evaluation | eng |
dc.type | Tese | pt_BR |
Arquivos
Pacote Original
1 - 1 de 1
Nenhuma Miniatura disponível
- Nome:
- Tese - Juliana Rodrigues - 2018.pdf
- Tamanho:
- 3.76 MB
- Formato:
- Adobe Portable Document Format
- Descrição:
Licença do Pacote
1 - 1 de 1
Nenhuma Miniatura disponível
- Nome:
- license.txt
- Tamanho:
- 1.71 KB
- Formato:
- Item-specific license agreed upon to submission
- Descrição: