Mapeamento imunoinformático de regiões conservadas da proteína hexon de adenovírus humano

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dc.contributor.advisor1Souza, Menira Borges de Lima Dias e
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0054562567103606pt_BR
dc.contributor.referee1Souza, Menira Borges de Lima Dias e
dc.contributor.referee2Fonseca, Simone Gonçalves da
dc.contributor.referee3Gardinassi, Luiz Gustavo Araújo
dc.creatorAnjos, Déborah Carolina Carvalho dos
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/5347902022546012pt_BR
dc.date.accessioned2020-09-04T12:14:48Z
dc.date.available2020-09-04T12:14:48Z
dc.date.issued2020-03-17
dc.description.abstractHuman Adenoviruses (HAdVs) are important infectious agents associated with high incidence, morbidity and mortality in immunocompromised patients, such as those undergoing allogeneic hematopoietic progenitor cell transplantation (allo-TCPH). HAdVs belong to the family Adenoviridae, genus Mastadenovirus, and further classified into seven species (A-G) and 103 genotypes, characterized so far. The HAdV capsid consists mainly of the hexon protein, which has four highly conserved regions (CR1 - 4) that are known for their immunogenic potential, being one of the main targets of the T and B cell-mediated anti-HAdV immune response. The aim of the present study was to perform the mapping of potentially immunogenic epitopes, located in the HAdV hexon CRs and to evaluate the HAdV infection in patients undergoing allo-TCPH. To this end, predictions of T and B cell epitopes and IFN-γ induction were performed, considering 101 HAdV genotypes with sequences available in databases. The most conserved and best classified epitopes were then selected by the prediction programs to perform the molecular docking analysis with HLA alleles of the study population, consisting of nine adult patients undergoing allo-TCPH. It was also carried out the HAdV research by TaqMan real-time polymerase chain reaction (qPCR) in the patient's serum samples. As a result, regions containing overlapping T and B cell epitopes were obtained and, based on immunoinformatics analysis (prediction and molecular docking), two peptides with high conservation and immunogenic potential were designed. Nine patients were positive for HAdV by qPCR TaqMan, with the average viral load found in the serum samples of the study population being 6.71x1011 CG / mL. The genomic sequencing of the positive samples returned sequences that showed 100% similarity with sequences of the HAdV C hexon protein, deposited in a database. The present study allowed the mapping of the main immunogenic regions located in the CRs of the HAdV hexon, as well as the construction of two peptides that will be used in future studies to evaluate the immune response of patients undergoing allo-TCPH, participating in the present study.eng
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dc.description.resumoOs Adenovírus Humanos (HAdVs) são importantes agentes infecciosos associados a elevada incidência e morbimortalidade em pacientes imunocomprometidos, como os submetidos a transplante alogênico de células progenitoras hematopoiéticas (alo-TCPH). Os HAdVs pertencem à família Adenoviridae, gênero Mastadenovirus, sendo ainda classificados em sete espécies (A-G) e 103 genótipos, caracterizados até o momento. O capsídeo de HAdV é constituído, majoritariamente pela proteína hexon, que apresenta quatro regiões altamente conservadas (CR1 – 4) e conhecidas por seu potencial imunogênico, sendo um dos principais alvos da resposta imune anti- HAdV mediada por células T e B. O objetivo do presente estudo foi realizar o mapeamento de epítopos potencialmente imunogênicos, localizados nas CRs da hexon de HAdV e avaliar a infecção por HAdV em pacientes submetidos ao alo-TCPH. Para tal, foram realizadas as predições de epítopos de células T e B e indução de IFN-γ, considerando 101 genótipos de HAdV com sequências disponíveis em bancos de dados. Foram então selecionados os epítopos mais conservados e melhores classificados pelos programas de predição para realizar a análise de docking molecular com alelos de HLA da população de estudo, constituída por nove pacientes adultos submetidos ao alo-TCPH. Foi realizada ainda, a pesquisa de HAdV por reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) TaqMan nas amostras de soro dos pacientes. Foram obtidas, como resultado, regiões contendo sobreposição de epítopos de células T e B e, com base nas análises imunoinformáticas (predição e docking molecular), foram desenhados dois peptídeos com elevada conservação e potencial imunogênico. Nove pacientes foram positivos para HAdV por qPCR TaqMan, sendo a carga viral média encontrada nas amostras de soro da população de estudo de 6,71x1011 CG/mL. O sequenciamento genômico das amostras positivas retornou sequências que apresentaram 100% de similaridade com sequências da proteína hexon de HAdV C, depositadas em banco de dados. O presente estudo permitiu o mapeamento das principais regiões imunogênicas localizadas nas CRs da hexon de HAdV, bem como a construção de dois peptídeos que serão utilizados em estudos futuros para a avaliação da resposta imune dos pacientes submetidos ao alo-TCPH, participantes do presente estudo.pt_BR
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiáspt_BR
dc.identifier.citationANJOS, D. C. C. Mapeamento imunoinformático de regiões conservadas da proteína hexon de adenovírus humano. 2020. 89 f. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Parasito-Hospedeiro) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2020.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/10560
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentInstituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG)pt_BR
dc.publisher.initialsUFGpt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Biologia da Relação Parasito-Hospedeiro (IPTSP)pt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/*
dc.subjectAdenovírus humanopor
dc.subjectAlo-TCPHpor
dc.subjectImunoinformáticapor
dc.subjectProteína hexonpor
dc.subjectViremiapor
dc.subjectHuman adenoviruseng
dc.subjectAllo-TCPHeng
dc.subjectImmunoinformaticseng
dc.subjectHexon proteineng
dc.subjectviremiaeng
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA::MICROBIOLOGIA APLICADApt_BR
dc.titleMapeamento imunoinformático de regiões conservadas da proteína hexon de adenovírus humanopt_BR
dc.title.alternativeImmunoinformatic mapping of conserved regions of hexon human adenovirus proteineng
dc.typeDissertaçãopt_BR

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