Identificação molecular de helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae)

Página do item simplificado
dc.contributor.advisor-co1Tembrock, Luke Raymond
dc.contributor.advisor-co2Gilligan, Todd Michael
dc.contributor.advisor1Cunha, Marcos Gomes da
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2006008625763742pt_BR
dc.contributor.referee1Cunha, Marcos Gomes da
dc.contributor.referee2Timm, Alicia Eva
dc.contributor.referee3Dianese, Érico de Campos
dc.contributor.referee4Coelho, Regina Melo Sartori
dc.contributor.referee5Godinho, Karina Cordeiro Albernaz
dc.creatorOliveira, Thayssa Monize Rosa de
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/2051386045777953pt_BR
dc.date.accessioned2023-03-20T15:48:58Z
dc.date.available2023-03-20T15:48:58Z
dc.date.issued2021-05-21
dc.description.abstractPreviously found only on Old World continents, the caterpillar Helicoverpa armigera Hübner (Lepidoptera: Noctuidae) is capable of great economic damage, coming to be considered one of the most destructive agricultural pests. Its identification through morphological analysis is only possible with complex dissection of the adult male genitalia. The morphology of all phases of the life cycle, egg, larva, pupa and adult, is very similar with the morphology of other species of the genus, making the identification difficult. As it is a highly invasive pest and correct identification is the first step to be taken to decide the best management strategy, we realize the need for precise, easy and fast tools for the identification of this species. Thus, the objective of the work was to develop specific primers and to optimize different protocols for use in real-time PCR and digital PCR methodologies in order to identify H. armigera, even if this sample is of poor quality, only a fragment and/or is mixed with other species. For that, design, selection and optimization of primer and probe concentrations, primer annealing temperature gradients, tests and adaptations with different DNA extraction methods were carried out, with or without post-DNA extraction purification, tests with different ratios of H. zea and H. armigera mixed in the same reaction, determination of the maximum sensitivity in both methodologies and interpretation of the obtained data. We present the protocols developed to successfully identify the specie H. armigera, both with real-time PCR and digital PCR methodologies.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2023-03-16T17:51:58Z No. of bitstreams: 2 Tese - Thayssa Monize Rosa de Oliveira - 2021.pdf: 3251620 bytes, checksum: 065fdd1eb7dcea341756b5b8b82ce44c (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5)en
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2023-03-20T15:48:57Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Thayssa Monize Rosa de Oliveira - 2021.pdf: 3251620 bytes, checksum: 065fdd1eb7dcea341756b5b8b82ce44c (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5)en
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2023-03-20T15:48:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Thayssa Monize Rosa de Oliveira - 2021.pdf: 3251620 bytes, checksum: 065fdd1eb7dcea341756b5b8b82ce44c (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: 4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347 (MD5) Previous issue date: 2021-05-21en
dc.description.resumoEncontrada anteriormente apenas em continentes do Velho Mundo, a lagarta Helicoverpa armigera Hübner (Lepidoptera: Noctuidae) é capaz de grandes danos econômicos, chegando a ser considerada uma das mais destrutivas pragas agrícolas. Sua identificação por meio da análise morfológica só é possível com dissecção complexa da genitália masculina adulta. A morfologia de todas as fases do ciclo de vida, ovo, larva, pupa e adulto, é muito semelhante com a morfologia de outras espécies do gênero, dificultando a identificação. Por ser praga altamente invasiva e observando-se que a correta identificação é o primeiro passo a ser tomado para decisão da melhor estratégia de manejo, percebemos a necessidade de ferramentas precisas, fáceis e rápidas para identificação dessa espécie. Assim, o objetivo do trabalho foi desenvolver primers específicos e otimizar diferentes protocolos para utilização nas metodologias de PCR em tempo real e PCR digital de forma a identificar H. armigera, mesmo que essa amostra seja de má qualidade, apenas um fragmento e/ou esteja misturada com outras espécies. Para tanto, foram realizados desenho, seleção e otimização das concentrações dos primers e sonda, gradientes de temperatura de anelamento dos primers, testes e adaptações com diferentes métodos de extração de DNA, com ou sem purificação pós-extração, testes com diferentes taxas de DNA de H. zea e H. armigera misturados em uma mesma reação, determinação da sensibilidade máxima em ambas as metodologias e interpretação dos dados obtidos. Dessa forma, apresentamos os protocolos desenvolvidos para identificar com sucesso a espécie H. armigera, tanto na metodologia de PCR em tempo real quanto na metodologia de PCR digital.pt_BR
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpt_BR
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiáspt_BR
dc.identifier.citationOLIVEIRA, T. M. R. Identificação molecular de helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae). 2021. 75 f. Tese (Doutorado em Agronomia) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2021.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/12678
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentEscola de Agronomia - EA (RMG)pt_BR
dc.publisher.initialsUFGpt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Agronomia (EA)pt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectLagarta do velho mundopor
dc.subjectPCRpor
dc.subjectPrimers específicospor
dc.subjectOld world bollwormeng
dc.subjectSpecie-specific primerseng
dc.subject.cnpqCIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADEpt_BR
dc.titleIdentificação molecular de helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae)pt_BR
dc.title.alternativeMolecular identification of helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae)eng
dc.typeTesept_BR

Arquivos

Pacote Original
Agora exibindo 1 - 1 de 1
Nenhuma Miniatura disponível
Nome:
Tese - Thayssa Monize Rosa de Oliveira - 2021.pdf
Tamanho:
3.1 MB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descrição:
Baixar
Licença do Pacote
Agora exibindo 1 - 1 de 1
Nenhuma Miniatura disponível
Nome:
license.txt
Tamanho:
1.71 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descrição:
Baixar

Coleções

Doutorado em Agronomia (EA)