Variabilidade genética e avaliação de sensibilidade a fungicidas em sclerotinia sclerotiorum proveniente de cultivo irrigado de feijoeiro

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dc.contributor.advisor1Silva, Silva Petrofeza da
dc.contributor.advisor1Latteshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4793542D5eng
dc.creatorArboleda, William Andrés López
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dc.date.accessioned2017-10-02T13:35:40Z
dc.date.issued2015-03-27
dc.description.abstractSclerotinia sclerotiorum is a phytopathogenic fungus that infects more than 400 plant species, including common bean. Genetic variability studies in connection with phenotypic traits of agronomic interest are important to drive the control strategies against this pathogen. The aims of this study were: to evaluate the genetic variability, fungicide sensitivity, aggressiveness and to determine the proportion of MAT (Mating Type) alleles of 79 isolates of S. sclerotiorum distributed in four populations from common bean. Two populations represented a single sampling location in two different times (2000 and 2013 growing seasons). To evaluate the fungicide sensitivity a cell viability test based on the alamarBlue dye using mycelial growth was standardized. Dose-response curves for fluazinam, procymidone and benomyl were estimated using this test and were compared with dose-response curves estimated by the mycelial growth inhibition on PDA plate and the FRAC (Fungicide Resistance Action Committee) protocol. Despite the differences to assess the fungicide sensitivity between the three methods, the dose-response curves showed similar trends for the three fungicides. The fungicide sensitivity assessment at the four populations showed low sensitivity to benomyl in the Planaltina population. Furthermore, this population presented a principally clonal population structure, with a haplotype represented by 18 out of 20 isolates. Significant population differentiation in all pairwise comparisons of phi, except the comparison between EV_2013-NH, was detected. Five genetically homogeneous groups were inferred by the DAPC analysis. No group was conformed by isolates from the four populations. Only two haplotypes between the two populations from the same sampling location were shared. The hypothesis of random mating was rejected at the four populations; however this hypothesis was not rejected at the two major populations inferred by the DAPC analysis. The screening of mating type locus showed a dominance of Inv+ isolates and a high proportion of Inv+/Inv- isolates (presumable heterokaryons).eng
dc.description.provenanceSubmitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2017-09-29T19:13:24Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - William Andrés López Arboleda - 2015.pdf: 1579315 bytes, checksum: 378fd0e65f3b2919d56630143950ed75 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
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dc.description.resumoSclerotinia sclerotiorum é um fungo fitopatogênico capaz de colonizar mais de 400 hospedeiras, sendo o agente causal do mofo branco no feijoeiro. Estudos de variabilidade genética associados a características fenotípicas de interesse agronômico, como a sensibilidade a fungicidas, oferecem informações importantes para direcionar estratégias de controle sobre este patógeno. Os objetivos deste trabalho foram avaliar a variabilidade genética, sensibilidade a fungicidas e agressividade de 79 isolados de S. sclerotiorum distribuídos em quatro populações procedentes de culturas de feijoeiro em pivô central. Duas destas populações representaram um único local de coleta em duas épocas diferentes (2000 e 2013). Para avaliar a sensibilidade a fungicidas foi padronizado um teste de viabilidade celular baseado no corante alamarBlue® sobre o crescimento micelial em microplaca de 96 poços. Curvas de dose-resposta para os fungicidas fluazinam, procimidona e benomyl, usando um isolado de S. sclerotiorum, foram estimadas com este método, e comparadas com curvas de dose-resposta obtidas com os métodos de inibição do crescimento em placa e o proposto pelo Fungicide Resistance Action Committee (FRAC). Apesar das diferentes abordagens as curvas dose-resposta mostraram tendências semelhantes para os três fungicidas. A avaliação da sensibilidade a fungicidas nas quatro populações indicou uma alta insensibilidade ao benomyl na população de Planaltina. Por outro lado, a estrutura populacional foi principalmente clonal com um haplótipo representado por 18 dos 20 isolados desta população. Diferenciação populacional significativa foi detectada em todas as comparações par a par do phi, com a exceção da comparação EV-2013-NH. A analise DAPC identificou cinco grupos geneticamente homogêneos. Nenhum dos grupos esteve constituído por isolados das quatro populações. Só dois haplótipos foram compartilhados pelas populações EV_2000 e EV_2013. A hipótese de acasalamento aleatório foi rejeitada nas quatro populações, no entanto não foi rejeitada nas duas maiores populações sugeridas pelo DAPC. O screening do Mating type locus (MAT) mostrou uma prevalência de isolados Inv+ e uma alta proporção de isolados Inv+/Inv-eng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationARBOLEDA, William Andrés López. Variabilidade genética e avaliação de sensibilidade a fungicidas em sclerotinia sclerotiorum proveniente de cultivo irrigado de feijoeiro. 2015. 79 f. Dissertação (Mestrado em Biologia) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2015.eng
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/7818
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicas - ICB (RG)eng
dc.publisher.initialsUFGeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Biologia (ICB)eng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectLócus MATpor
dc.subjectSclerotinia sclerotiorumpor
dc.subjectSensibilidade a fungicidaspor
dc.subjectVariabilidade genéticapor
dc.subjectVirulênciapor
dc.subjectGenetic variabilityeng
dc.subjectFungicide sensitivityeng
dc.subjectMating type locuseng
dc.subjectSclerotinia sclerotiorumeng
dc.subjectVirulenceeng
dc.subject.cnpqMORFOLOGIA::CITOLOGIA E BIOLOGIA CELULAReng
dc.titleVariabilidade genética e avaliação de sensibilidade a fungicidas em sclerotinia sclerotiorum proveniente de cultivo irrigado de feijoeiroeng
dc.typeDissertaçãoeng

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