Detecção com técnicas moleculares de Leifsonia xyli subsp. xyli e Xanthomonas albilineans em cana-deaçúcar.

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dc.contributor.advisor-co1Dianese , Érico de Campos
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2503998782869167por
dc.contributor.advisor1Cunha , Marcos Gomes da
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2006008625763742por
dc.contributor.referee1Cunha , Marcos Gomes da
dc.contributor.referee2Dianese , Érico de Campos
dc.contributor.referee3Carrer Filho , Renato
dc.contributor.referee4Martins , Samuel Júlio
dc.contributor.referee5Reis , Américo José dos
dc.creatorDias , Vanessa Duarte
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/9661520137798567por
dc.date.accessioned2017-02-06T12:13:30Z
dc.date.issued2016-06-30
dc.description.abstractThe sugarcane production areas are increasing in Brazil due to increased ethanol consumption by flex fuel cars. The planted area is growing, but productivity has been declining in recent years, and factors such as incidence of diseases in the crop may be contributing to this situation. Among the diseases, bacteria such as scald of the leaves and ratoon stunting disease are of great importance to the crop because they can reduce productivity by up to 30%. In addiction and the symptoms are not always displayed in the field, thus requiring advanced techniques to detect such bacterial diseases For Leifsonia xyli subsp. xyli, which causes rickets in the ratoon cane sugar control measure most commonly used besides varietal resistance is thermally treating the billets that will serve seedlings. Thus, the purpose of the first study was to perform the heat water treatment of billets with the addition of kasugamycin antibiotic dosage 300mL/100L H2O in order to try to reduce bacterial escape from the standard treatments, as also in other time and temperature combinations proposed: T1 = 52°C/30 '; T2 = 52°C/1hr; T3 = 50°C/1hr; T4 = 50°C/2hrs; T5 = 52°C/30 '+ antibiotic; T6 = 52°C/1hr + antibiotic; T7 = 50°C/1hr + antibiotic; T8 = 50°C/2hrs + antibiotic; T9 = antibiotic and T10 = control. Moreover, among techniques for diagnosis of such diseases, the most used by laboratories are the serological tests which have the advantage of quantitatively detecting the presence of bacteria on the stems but, however, has the disadvantage of detecting only when the bacterial population is relatively high. PCR technique that is one of the techniques considered most sensitive, has not been used in practice, as this high sensitivity has not been used, the protocols do not detect bacterial diseases in the case of latent infection, where bacterial title is relatively low. So the other work aimed at improving the Xanthomonas albilineans detection developing a LAMP protocol, and compared to other techniques of detection and isolation in semiselective medium, PCR and nested PCR for both symptomatic samples and for asymptomatic and the latter where population in general pathogen is low, we improved Nested one protocol to detect the leaf scald in latent infections by comparing the vascular fluid extraction techniques combined with four different DNA extraction protocols.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-02-06T12:12:53Z No. of bitstreams: 2 Tese - Vanessa Duarte Dias - 2016.pdf: 2283005 bytes, checksum: 467160bb33424613a588c7251fabc187 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
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dc.description.resumoO cultivo de cana-de-açúcar está em expansão no Brasil, devido principalmente ao crescente consumo de etanol por carros bicombustíveis. A área plantada está em crescimento, mas a produtividade nos últimos anos vem decrescendo, e fatores como incidência de doenças podem estar contribuindo para tal situação. Dentre as doenças, as bacterianas, como o raquitismo das soqueiras e a escaldadura das folhas, possuem grande importância para a cultura, pois podem reduzir a produtividade em até 30%. Nem sempre os sintomas são visualizados em campo, necessitando assim de técnicas avançadas de detecção ou controle. Para a bacteria Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx), que causa o raquitismo das soqueiras em cana-de-açúcar a medida de controle mais utilizada além da resistência varietal é tratar termicamente os toletes que servirão de mudas. Assim o objetivo do primeiro trabalho foi realizar o tratamento térmico dos toletes com a adição de antibiótico casugamicina à dosagem de 300mL/100L de H2O com o intuito de tentar reduzir o escape bacteriano dentre os tratamentos padrões, como também em outras combinações de tempo e temperatura propostos: T1= 52ºC/30’; T2= 52ºC/1hr; T3= 50ºC/1hr; T4= 50ºC/2hrs; T5= 52ºC/30’ + antibiótico; T6= 52ºC/1hr + antibiótico; T7= 50ºC/1hr + antibiótico; T8= 50ºC/2hrs + antibiótico; T9= antibiótico e T10= testemunha. Além disso, dentre as técnicas para diagnose de tais doenças, as mais utilizadas por laboratórios são os testes sorológicos, que tem como vantagem detectar quantitativamente a presença das bactérias nos colmos mas, no entanto, possui a desvantagem de detectar somente quando a população bacteriana está relativamente alta. Já a técnica de PCR que é uma das tecnicas consideradas mais sensíveis, não vem sendo utilizada na prática, pois esta alta sensibilidade não vem ocorrendo. Os protocolos não detectam as bacterioses no caso de infecção latente, onde o título bacteriano é relativamente baixo. Portanto, os demais trabalhos visaram aprimorar a detecção Xanthomonas albilineans desenvolvendo um protocolo LAMP, e comparando com outras tecnicas de detecção como isolamento em meio semi-seletivo, PCR e Nested-PCR, tanto para amostras sintomáticas quanto para assintomáticas. Para estas últimas onde a população do patógeno de maneira geral é baixa, aprimoramos um protocolo Nested para detectar escaldadura das folhas em infecções latentes, comparando técnicas de extração do fluído vascular combinado a quatro diferentes protocolos de extração de DNA.por
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPqpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationDIAS, V. D. Detecção com técnicas moleculares de Leifsonia xyli subsp. xyli e Xanthomonas albilineans em cana-deaçúcar.. 2016. 107 f. Tese (Doutorado em Agronomia) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2016.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/6824
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentEscola de Agronomia e Engenharia de Alimentos - EAEA (RG)por
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Agronomia (EAEA)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectFitobactériaspor
dc.subjectInfecções latentespor
dc.subjectLAMPpor
dc.subjectNested-PCRpor
dc.subjectSaccharum sp.por
dc.subjectLatent infectionseng
dc.subjectLAMPeng
dc.subjectNested-PCReng
dc.subjectSaccharum sp.eng
dc.subjectPhytobacteriaeng
dc.subject.cnpqAGRONOMIA::FITOSSANIDADEpor
dc.titleDetecção com técnicas moleculares de Leifsonia xyli subsp. xyli e Xanthomonas albilineans em cana-deaçúcar.por
dc.title.alternativeDetection with molecular techniques of Leifsonia xyli subsp. xyli e Xanthomonas albilineans in sugarcaneeng
dc.typeTesepor

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