Detecção por PCR em tempo real e identificação molecular de clostridium estertheticum proveniente de carne bovina e ambientes de matadouros frigoríficos brasileiros

Página do item simplificado
dc.contributor.advisor1Mesquita, Albenones Jose de
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3180029815183858por
dc.contributor.referee1Mesquita, Albenones Jose de
dc.contributor.referee2André, Maria Claudia Dantas Porfírio Borges
dc.contributor.referee3Bataus, Luiz Artur Mendes
dc.contributor.referee4Mazzoni, Rolando Alfredo
dc.contributor.referee5Soares, Renata de Bastos Ascenço
dc.creatorMarra, Kelly Nobre
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/7984848783062844por
dc.date.accessioned2016-12-26T14:21:56Z
dc.date.issued2012-05-09
dc.description.abstractThe involvement of Clostridium estertheticum as agents of deterioration of chilled beef packaged under vacuum from slaughterhouse brazilian, has been reported since 2007. Once detected, and presents the main sources of contamination in slaughter establishments, there was the need to advance the search for new knowledge about this Clostridia, however, the classical microbiological methods for their detection are considered difficult to implement because they require hard work and take a long time. PCR can be a quick and efficient detection of clostridia incriminated in the deterioration of beef chilled vacuum packaged and refrigerated environments slaughterhouses, without isolation of pure cultures. The objective of this study was to develop a test for realtime PCR for detection of Clostridium estertheticum in bovine meat and environments of slaughterhouse brazilian, as well as the molecular identification of isolates of Clostridium estertheticum by means of AFLP and RFLP techniques - PCR. The analytical results were compared with conventional PCR and confirmed by isolation. The Real-Time PCR assay for detection of Clostridium estertheticum in bovine meat and environments of slaughterhouse brazilian, was efficient. Evidence for the presence and distribution of C. estertheticum the sources studied and the technique of RT-PCR provided the highest percentage of positive samples from slaughterhouses that refrigerators Conventional PCR, and this is confirmed by isolation, which has become an important alternative for the detection of C. estertheticum in bovine meat and environments of slaughterhouse without isolation. The isolates used showed general similarity of 42.4%, suggesting high genetic diversity. In addition, the isolates obtained from samples of ambient and refrigerated meat tufted not show significant similarity, greater than 80%, used with any typical strain. The similarity found between the isolates may be indicative of possible similarity between those from meats and puffed from between those environments and equipment. The study revealed that additional steps necessary x for the characterization of Brazilian isolates, especially sequencing of other regions of the DNA so as to determine their taxonomic position.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-12-21T16:24:41Z No. of bitstreams: 2 Tese - Kelly Nobre Marra - 2012.pdf: 2565911 bytes, checksum: f0057800bcb5bba97865ae5ccc3e4507 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-12-26T14:21:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Kelly Nobre Marra - 2012.pdf: 2565911 bytes, checksum: f0057800bcb5bba97865ae5ccc3e4507 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2016-12-26T14:21:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Kelly Nobre Marra - 2012.pdf: 2565911 bytes, checksum: f0057800bcb5bba97865ae5ccc3e4507 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2012-05-09eng
dc.description.resumoO envolvimento de Clostridium estertheticum como agente de deterioração de carnes bovinas refrigeradas embaladas a vácuo provenientes de ambientes de frigoríficos no Brasil, vem sendo relatado desde 2007. Uma vez detectados, bem como apontadas as principais fontes de contaminação nos estabelecimentos de abate, surgiu à necessidade de avançar na busca de novos conhecimentos sobre esses clostrídios. No entanto, os métodos microbiológicos clássicos para sua detecção são considerados de difícil execução, pois exigem muito trabalho e demandam muito tempo. A PCR pode ser uma alternativa rápida e eficiente para detecção de clostrídios incriminados na deterioração de carnes bovinas refrigeradas embaladas a vácuo e ambientes de matadouros-frigoríficos, sem a necessidade de isolamento em culturas puras. Objetivou-se com o presente estudo desenvolver um ensaio de PCR em Tempo Real para detecção de Clostridium estertheticum em carnes bovinas e superfícies diversas de matadouros-frigoríficos brasileiros, assim como a identificação molecular de isolados de Clostridium estertheticum, por meio das técnicas RFLP e AFLP – PCR. Os resultados analíticos foram comparados com PCR Convencional e confirmados pelo isolamento. O ensaio PCR em Tempo Real desenvolvido para detecção de Clostridium estertheticum em carnes bovinas e superfícies diversas de matadouros-frigoríficos brasileiros, mostrou-se eficiente. Evidencia-se a presença e disseminação de C. estertheticum nas fontes estudadas e a técnica de PCR em Tempo Real proporcionou maior percentual de positividade para amostras de matadouros- frigoríficos que a técnica de PCR Convencional, sendo este confirmado pelo isolamento, o que demonstra ser uma alternativa importante na detecção de C. estertheticum de carnes bovinas e superfícies diversas de matadouros-frigoríficos sem a necessidade de isolamento. Os isolados utilizados revelaram similaridade geral de 42,4%, sugerindo alta diversidade genética. Além viii disso, os isolados obtidos a partir de amostras de ambientes frigoríficos e carnes tufadas não apresentaram similaridade significativa, maior que 80%, com nenhuma cepa padrão utilizada. A similaridade encontrada entre os isolados pode ser indicativa de possível semelhança entre aqueles provenientes de carnes tufadas e entre aqueles provenientes de ambientes e equipamentos. O estudo mostrou serem necessárias etapas complementares de caracterização dos isolados brasileiros, principalmente sequenciamento de outras regiões do DNA para assim determinar sua posição taxonômica.por
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationMARRA, K. N. Detecção por PCR em tempo real e identificação molecular de clostridium estertheticum proveniente de carne bovina e ambientes de matadouros frigoríficos brasileiros. 2012. 78 f. Tese (Doutorado em Ciência Animal) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2012.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/6639
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentEscola de Veterinária e Zootecnia - EVZ (RG)por
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ciência Animal (EVZ)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectCarnepor
dc.subjectDeterioraçãopor
dc.subjectPCR em Tempo Realpor
dc.subjectTufamentopor
dc.subjectBlown packeng
dc.subjectDeteriorationeng
dc.subjectMeateng
dc.subjectReal-Time PCReng
dc.subject.cnpqCIENCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS::TECNOLOGIA DE ALIMENTOSpor
dc.titleDetecção por PCR em tempo real e identificação molecular de clostridium estertheticum proveniente de carne bovina e ambientes de matadouros frigoríficos brasileirospor
dc.title.alternativeDetection by PCR realtime and molecular identification of clostridium estertheticum in bovine meat and environments of slaughterhouse brazilianeng
dc.typeTesepor

Arquivos

Pacote Original
Agora exibindo 1 - 1 de 1
Nenhuma Miniatura disponível
Nome:
Tese - Kelly Nobre Marra - 2012.pdf
Tamanho:
2.45 MB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descrição:
Baixar
Licença do Pacote
Agora exibindo 1 - 1 de 1
Nenhuma Miniatura disponível
Nome:
license.txt
Tamanho:
2.11 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descrição:
Baixar

Coleções

Doutorado em Ciência Animal (EVZ)