Genômica de populações e genética geográfica de bovinos Pantaneiros e Curraleiro Pé-Duro com uso de polimorfismos de base única (SNP)

dc.contributor.advisor-co1Pimentel, Concepta Margaret McManus
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/6052239712915301por
dc.contributor.advisor-co2Juliano, Raquel Soares
dc.contributor.advisor-co2Latteshttp://lattes.cnpq.br/4884381347303453por
dc.contributor.advisor1Sereno, José Robson Bezerra
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0848686465662209por
dc.contributor.referee1Sereno, José Robson Bezerra
dc.contributor.referee2Caetano, Alexandre Rodrigues
dc.contributor.referee3Cruz, Aparecido Divino da
dc.contributor.referee4Moura, Maria Ivete de
dc.contributor.referee5Diniz Filho, José Alexandre Felizola
dc.creatorSilva, Marcelo Corrêa da
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/1263108475535325por
dc.date.accessioned2016-04-18T10:51:37Z
dc.date.issued2015-09-21
dc.description.abstractLivestock production has played a major role in social-economic aspects of rural development worldwide. In South America the introduction of domestic breeds such as cows, sheep and goats occurred during Spanish and Portuguese colonization expeditions over five hundred years ago. The Pantaneiro and Curraleiro Pé-Duro cattle breeds originate from this exact context and resemble historic, cultural and ecological aspects of traditional cattle farming in Brazil. This is characterized by rough and extensive breeding systems placed in many ecosystems of this country. Small population sizes and severe loss of genetic diversity in livestock breeds are of great concern regarding the scenario of global warming, emphasis on the sustainability of farming activities, the need of alternatives to attend market trends and promote rural development in a local perspective. This study was undertaken to explore patterns of genetic diversity in Pantaneiro e Curraleiro Pé-Duro cattle, aiming to identify differences between groups reared in several regions of Central-West, Central, North and Northeast of Brazil. Animals were genotyped using a SNP (single nucleotide polymorphism) chip containing over fifty thousand markers. Different analytical procedures were carried out using differentiation index, estimates of common ancestry, simple and multivariate clustering, inbreeding coefficients, genetic and also geographical distances. Spatial analysis was developed to allow the identification of patterns of genetic variation, specific geographical regions and herds of greater genetic differentiation. The results furnish insights in order to develop strategies to preserve genetic variability in Pantaneiro and Curraleiro Pé-Duro cattle.eng
dc.description.resumoOs bovinos são tradicionalmente utilizados como fonte de proteína animal na alimentação humana em diversas regiões do mundo. Na América do Sul esta espécie foi introduzida por colonizadores espanhóis e portugueses e há mais de 500 anos tem sido disseminada no Brasil com importância alimentar e socioeconômica. Bovinos Pantaneiros e Curraleiro Pé-Duro são remanescentes de bovinos trazidos da região ibero-americana por meio de navios. Atualmente são considerados patrimônios históricos e culturais do país, com destaque à pecuária extensiva e tradicional que é praticada em diversos biomas do interior do Brasil, como o Pantanal, o Cerrado e a Caatinga. O baixo número de indivíduos existente, a demanda por uma produção animal mais competitiva e economicamente viável, com potencial de agregação de valor ou diferencial em termos de rusticidade, tem sido favoráveis para a discussão da conservação e maior utilização de raças localmente adaptadas. Isso tem tido maior destaque também em função do advento do aquecimento global e maior valorização de especificidades que caracterizam circunstâncias sociais, ecológicas e produtivas em escala local. Assim, este estudo foi desenvolvido a fim de explorar e compreender padrões de diversidade genética em populações de bovinos Pantaneiros e Curraleiro Pé-Duro, investigando-se diferenças e semelhanças genéticas entre indivíduos e rebanhos amostradas em diferentes biomas das regiões centro oeste, norte e nordeste do Brasil. Bovinos foram amostrados e genotipados com uso de um chip contendo mais de 50 mil marcadores polimórficos de base única (single nucleotide polymorphism, SNP). Diferentes técnicas de análise genética foram realizadas como o uso de distância genéticas, índices de diferenciação genética, estimativas de ancestralidade comum, endogamia e análises de dispersão e agrupamento uni e multivariados. Foram utilizados métodos de estatística espacial, que possibilitaram a identificação de padrões de variabilidade genética em função de distâncias geográficas e a identificação de descontinuidades genéticas, revelando uma compreensão inédita acerca da diferenciação entre grupos formados com base em um critério geopolítico ou com base em similaridade genética. Os resultados obtidos fornecem subsídios para a formação de grupos experimentais, a troca de material genético entre criadores, planejamentos participativos para a preservação e gestão sustentável desses bovinos junto às associações de criadores, entidades de pesquisa e demais atores envolvidos.por
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationSILVA, M. C. Genômica de populações e genética geográfica de bovinos Pantaneiros e Curraleiro Pé-Duro com uso de polimorfismos de base única (SNP). 2015. 170 f. Tese (Doutorado em Ciência Animal) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2015.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/5481
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentEscola de Veterinária e Zootecnia - EVZ (RG)por
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ciência Animal (EVZ)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectAnálise espacialpor
dc.subjectDescontinuidade genéticapor
dc.subjectConservação genéticapor
dc.subjectEstrutura populacionalpor
dc.subjectFstpor
dc.subjectRecursos zoogenéticospor
dc.subjectConservation genomicseng
dc.subjectLandscape geneticseng
dc.subjectLivestock biodiversityeng
dc.subjectPopulation structureeng
dc.subjectSpatial analysiseng
dc.subject.cnpqZOOTECNIA::PRODUCAO ANIMALpor
dc.titleGenômica de populações e genética geográfica de bovinos Pantaneiros e Curraleiro Pé-Duro com uso de polimorfismos de base única (SNP)por
dc.title.alternativeFirst report of population genomics in pantaneiro and Curraleiro Pé-Duro catle using single nucleotide polymorphisms (SNP) and a geographical genetics approacheng
dc.typeTesepor

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