Epidemiologia molecular de bastonetes Gram negativos isolados em uma Unidade de Terapia Intensiva de um hospital escola de Goiânia-GO

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dc.contributor.advisor-co1Pereira, Maria das Graças Cabral
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0490246549210664por
dc.contributor.advisor1Cardoso, Juliana Lamaro
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0768752229180519por
dc.contributor.referee1Cardoso, Juliana Lamaro
dc.contributor.referee2André, Maria Cláudia Dantas
dc.contributor.referee3Barbosa, Mônica Santiago
dc.creatorPires, Cyndi Heleinne
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/4635599126988661por
dc.date.accessioned2017-05-05T12:52:04Z
dc.date.issued2017-03-10
dc.description.abstractGram-negative bacilli (BGN) comprise species that are sources of community-acquired infections and infections associated with health care. They are easily spread among humans and have the ability to acquire and share genetic material by horizontal gene transfer. The objective of the study was to determine the prevalence of BGN isolated from the environment and patients of an ICU of a university hospital in the city of Goiânia-GO, to determine the susceptibility profile of the isolates, and their genetic similarity. The collections were performed in patients and environments of the Medical ICU of a university hospital in the city of Goiânia-GO, between December 2012 and June 2014. After collection, the swabs were packed in heart brain infusion broth. Isolation was performed on MacConkey agar and species identification was performed by multiplex PCR. Diffusion disc tests were performed to determine the antimicrobial susceptibility profile and phenotypic tests for the detection of resistance phenotypes. Next, monoplex PCR was performed to detect 15 genes encoding beta-lactam resistance. The PFGE of P. mirabilis, E. coli and A. baumannii isolates were also performed to verify the genetic similarity between the circulating strains. A total of 526 swabs were collected, of which 134 were patients and 392 were environment. The prevalence of BGN found was 55.3% (291/526), and of these, 219 (75.2%) were identified among the species H. alvei (36.8%), A. baumannii (26.8 %), P. mirabilis (7.6%), P. aeruginosa (2.4%) and E. coli (1.7%). Among the bacteria identified, 51 (23.3%) were resistant to beta-lactams, of which 8 (15.7%) were ESBL-producing. Of the 24 (10.9%) isolates resistant to carbapenems, 10 (41.6%) were carbapenemase producers. The most prevalent beta-lactam resistance genes in the environment samples were blaSHV and blaIMT, both with 39.3%, and blaSME (35.7%). In patients the most prevalent genes were blaSHV (43.5%), blaOXA (39.1%) and blaIMG (34.8%). The dendrograms resulting from the macrorrest profiles show an outbreak of contamination / colonization by a dominant clone of A. baumannii in the ICU in the year 2013 and in 2014 the appearance of different enterobacteria in detriment of A. baumanni revealing the predominance between species in different years. The results suggest that the prevalence of BGN, mainly of enterobacteria, is high in health institutions, mainly in ICUs. The hospital environment can be a potential source of contamination and infection to patients and health professionals, as well as acting as reservoir of resistance genes, deserving greater attention and development of educational and hygienic-sanitary measures to control the patient-environment interface.eng
dc.description.provenanceSubmitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-05-04T17:58:44Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cyndi Heleinne Pires - 2017.pdf: 2063752 bytes, checksum: 2036ddcd50484f9d6ad492b261d8b7c6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)eng
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dc.description.resumoOs bacilos Gram negativos (BGN) compreendem espécies que são fontes de infecções comunitárias e infecções associadas à assistência à saúde. São de fácil propagação entre os seres humanos e possuem capacidade de adquirir e compartilhar material genético por transferência horizontal de genes. O objetivo do estudo foi determinar a prevalência de BGN isolados de ambiente e pacientes de uma UTI de um hospital universitário do município de Goiânia-GO, determinar o perfil de suscetibilidade dos isolados, e a similaridade genética dos mesmos. As coletas foram realizadas em pacientes e ambientes da UTI Médica de um hospital universitário do município de Goiânia-GO, entre dezembro de 2012 e junho de 2014. Após a coleta, os swabs foram acondicionados em caldo infusão de cérebro coração. O isolamento foi realizado em ágar Mac Conkey e a identificação das espécies foi realizada por PCR multiplex. Foram realizados testes de disco difusão para determinação do perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos e testes fenotípicos para detecção de fenótipos de resistência. Em seguida, foi realizado PCR monoplex para detecção de 15 genes que codificam resistência aos betalactâmicos. Também foi realizado o PFGE dos isolados de P. mirabilis, E. coli e A. baumannii para verificar a similaridade genética entre as cepas circulantes. Foram coletados um total de 526 swabs, sendo 134 de pacientes e 392 de ambiente. A prevalência de BGN encontrada foi de 55,3% (291/526), e, destes, 219 (75,2%) foram identificados como H. alvei (36,8%), A. baumannii (26,8%), P. mirabilis (7,5%), P. aeruginosa (2,4%) e E. coli (1,7%). Dentre as bactérias identificadas, 51 (23,3%) foram resistentes aos betalactâmicos, sendo 8 (15,7%) produtoras de ESBL. Dos 24 (10,9%) isolados resistentes aos carbapenêmicos, 10 (41,6%) foram produtores de carbapenemase. Os genes de resistência aos betalactâmicos mais prevalentes nas amostras de ambiente foram blaSHV e blaGIM, ambos com 39,3%, e blaSME (35,7%). Em pacientes, os genes mais prevalentes foram blaSHV (43,5%), blaOXA (39,1%) e blaGIM (34,8%). Os dendrogramas resultantes dos perfis de macrorrestrição mostram um surto de contaminação/colonização por um clone dominante de A. baumannii na UTI, no ano de 2013 e, em 2014, o surgimento de diferentes enterobactérias em detrimento do A. baumanni revelando a predominância entre espécies nos diferentes anos do estudo. Os resultados encontrados sugerem que a prevalência de BGN, sobretudo de enterobactérias, é elevada em instituições de saúde, principalmente em UTIs. O ambiente hospitalar pode ser fonte potencial de contaminação e infecção aos pacientes e aos profissionais de saúde, além de atuar como reservatório de genes de resistência, merecendo maior atenção e desenvolvimento de medidas educacionais e higiênico-sanitárias para o controle da interface paciente-ambiente.por
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationPIRES, C. H. Epidemiologia molecular de bastonetes Gram negativos isolados em uma Unidade de Terapia Intensiva de um hospital escola de Goiânia-GO. 2017. 104 f. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Parasito-Hospedeiro) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2017.por
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/7267
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Goiáspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentInstituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG)por
dc.publisher.initialsUFGpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Biologia da Relação Parasito-Hospedeiro (IPTSP)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectBGNpor
dc.subjectUTIpor
dc.subjectAmbientepor
dc.subjectPCRpor
dc.subjectPFGEpor
dc.subjectEnvironmenteng
dc.subject.cnpqMICROBIOLOGIA::MICROBIOLOGIA APLICADApor
dc.titleEpidemiologia molecular de bastonetes Gram negativos isolados em uma Unidade de Terapia Intensiva de um hospital escola de Goiânia-GOpor
dc.title.alternativeMolecular epidemiology of Gram negative rods isolated in an Intensive Care Unit of a school hospital in Goiânia-GOeng
dc.typeDissertaçãopor

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