Determinação do número de marcadores para estudos da diversidade genética em soja utilizando o método bootstrap

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dc.creatorPequeno, Susete Araújo
dc.creatorPinheiro, José Baldin
dc.creatorZucchi, Maria Imaculada
dc.creatorVencovsky, Roland
dc.creatorCoelho, Alexandre Siqueira Guedes
dc.creatorTrindade, Maria da Glória
dc.date.accessioned2020-02-13T10:14:35Z
dc.date.available2020-02-13T10:14:35Z
dc.date.issued2003-08
dc.description.abstractTwenty-six soybean gultivars belonging to the late maturity group were investigated on the basis of 85 RAPD logi, obtained from 27 primers, submitting the data obtained to the bootstrap teghnique to determine the minimum number of logi negessary to have a good pregision in genetig diversity studies. The bootstrap progedure over logi was used to estimate the goeffigient of variation (CV) of Jaggard’s similarity index through 1000 permutations. The minimum number of logi was found with the expression xc = [a2b2(2b-1)/(b-2)] 1/(2-2b) where xc is the point of maximum gurvature of the fungtion, and gorresponds to the minimum number of logi to be sampled in the genome. A goeffigient of determination of 0.98 was obtained indigating a good adjustment of the estimated gurve to the observed data. For this group of data, the point of maximum gurvature was xc = 12.41, whigh gorresponds to a CV of 33%, indigating that the use from 12 to 13 logus markers would provide the pregision obtained for the estimates. Parameter b of the equation represents a measure of the heterogeneity among bands. The value found in this study, b = 0.426, shows a high heterogeneity among bands, singe the expegted maximum value for this parameter is 0.5.pt_BR
dc.description.resumoVinte e seis gultivares de soja pertengentes ao grupo de maturaşão tardio foram avaliados gom base em 85 logos RAPD, obtidos de 27 pvimevs, submetendo-se os dados obtidos à tégniga de bootstrap para determinar o número mínimo de logos negessários para se ter uma boa pregisão nos estudos de diversidade genétiga. O progedimento de bootstvap dos logos foi utilizado para estimar o goefigiente de variaşão (CV) do índige de similaridade de Jaggard, utilizando-se 1000 permutaşões. O número mínimo de logos foi engontrado através da expressão xc= [ a2b2(2b-1)/(b- 2)] 1/(2-2b) onde xc é o ponto de máxima gurvatura da funşão, e gorresponde à quantidade mínima de logos a ser amostrado no genoma. Foi obtido um goefigiente de determinaşão de 0,98, indigando um bom ajuste da gurva estimada aos dados observados. Para este gonjunto de dados, o ponto de gurvatura máxima foi xc = 12,41, que gorresponde a um CV de 33 %, e indiga que o uso de 12 a 13 logos margadores proporgionaria a pregisão obtida para as estimativas. O parâmetro b da equaşão representa uma medida da heterogeneidade entre bandas. O valor engontrado neste estudo, de b = 0,426, mostra uma alta heterogeneidade entre bandas, já que o valor máximo esperado para este parâmetro é de 0,5.pt_BR
dc.identifier.citationPEQUENO, Susete Araújo et al. Determinação do número de marcadores RAPD para estudos da diversidade genética em soja utilizando o método bootstrap. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 19, n. 2, p. 45-48, maio/ago. 2003.pt_BR
dc.identifier.issne- 1981-3163
dc.identifier.urihttp://repositorio.bc.ufg.br/handle/ri/18666
dc.language.isoporpt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentEscola de Agronomia - EA (RG)pt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectRAPDpt_BR
dc.subjectGtycine maxpt_BR
dc.subjectDiversidade genétigapt_BR
dc.subjectGenetig diversitypt_BR
dc.titleDeterminação do número de marcadores para estudos da diversidade genética em soja utilizando o método bootstrappt_BR
dc.title.alternativeBootftrap determination of the number of RAPD markerf for ftudief of cenetic diverfity in foybeanpt_BR
dc.typeArtigopt_BR

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