Estudo epidemiológico e molecular da variante Omicron do SARS-CoV-2 no Estado do Tocantins
dc.contributor.advisor-co1 | Souza, Ueric José Borges de | |
dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/6340952274603852 | |
dc.contributor.advisor1 | Soares, Celia Maria de Almeida | |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/8539946335852637 | |
dc.contributor.referee1 | Soares, Celia Maria de Almeida | |
dc.contributor.referee2 | Bailão, Alexandre Melo | |
dc.contributor.referee3 | Souza, Menira Borges de Lima dias e | |
dc.contributor.referee4 | Oliveira, Lucas Nojosa | |
dc.contributor.referee5 | D’Alessandro, Walmirton Bezerra | |
dc.creator | Santos, Mateus Silva | |
dc.creator.Lattes | https://lattes.cnpq.br/4059367759608845 | |
dc.date.accessioned | 2024-10-08T19:01:04Z | |
dc.date.available | 2024-10-08T19:01:04Z | |
dc.date.issued | 2024-06-25 | |
dc.description.abstract | Introduction: SARS-CoV-2 infection associated with COVID-19 is one of the greatest global public health challenges, contributing to high morbidity and mortality in different age groups, with some population segments being more affected. The emergence of new variants of the SARS-CoV-2 virus, such as Omicron, is a reflection of selective advantage, translated as greater transmissibility and the ability to replicate in people previously exposed to the virus. In Brazil, the variant was very prominent, even when the numbers of immunized individuals were already high. Therefore, this research aims to promote an epidemiological and molecular study on the Omicron variant of SARS-CoV-2 in the state of Tocantins. Methods: This is an analytical cross-sectional study with a quantitative approach, conducted using SARS-CoV-2 positive samples from the Central Laboratory of Public Health of Tocantins (LACEN-TO). The samples were sequenced and taken to experiments in order to verify the quality of the sequencing, detect possible mutations and identify the main variants of concern. Subsequently, phylogenetic analysis was performed in order to observe the degree of dispersion of the most predominant variant in the state of Tocantins. Results: In the present study, 556 samples positive for the Omicron variant of SARS-CoV-2 were used. Among the results, it was observed that the state of Tocantins presented, during the study period, about 39 lineages of the Omicron variant, some of which were associated with a higher transmissibility rate. The biggest highlight was the XBB.1.18.1 and XBB.1.5 subvariants, being one of the main circulating in Tocantins in 2023. Phylogenetic analyses suggest that the state may have contributed to the dispersion of the subvariants not only in Brazil but also in the world. Conclusions: The results of the present study showed a high prevalence of the Omicron variant in Tocantins between December 2021 and June 2023, in addition to showing that the state may have contributed to the spread of the XBB.1.18.1 subvariant in Brazil. Relevance and impact: It is worth noting that due to the high frequency of mutations of the Omicron variant of SARS-CoV-2, surveillance is necessary to identify possible new entries of the virus not only in the northern Brazilian state but also throughout the country. | eng |
dc.description.resumo | Introdução: A infeccção pelo SARS-CoV-2 associada à COVID-19 é um dos maiores desafios de saúde pública mundial, contribuindo para uma elevada morbimortalidade em diferentes faixas etárias, sendo alguns segmentos populacionais mais afetados. O surgimento de novas variantes do vírus SARS-CoV-2 como a Ômicron, é reflexo de vantagem seletiva, traduzida como maior transmissibilidade e capacidade de se replicar em pessoas previamente expostas ao vírus. No Brasil, a variante teve bastante destaque, mesmo quando os números de indivíduos imunizados já eram altos. Portanto essa pesquisa tem como objetivo promover um estudo epidemiológico e molecular sobre a variante Ômicron do SARS-CoV-2 no estado do Tocantins. Métodos: Estudo caracterizado como transversal analítico, com abordagem quantitativa, realizado mediante as amostras positivas para SARS-CoV-2 do Laboratório Central de Saúde Pública do Tocantins (LACEN-TO). As amostras foram sequenciadas e levadas a experimentos a fim de verificar qualidade do sequenciamento, detectar possíveis mutações e identificar as principais variantes de preocupação. Posteriormente foi realizada análise filogenética de modo a observar o grau de dispersão da variante mais predominante no estado do Tocantins. Resultados: Foi utilizado no presente estudo 556 amostras positivas para variante Ômicron do SARS-CoV-2. Dentre os resultados, foi observado que o estado do Tocantins apresentou, durante o período estudo, cerca de 39 linhagens da variante Ômicron, sendo algumas associadas a uma maior taxa de transmissibilidade. O destaque maior foi para as subvariantes XBB.1.18.1 e XBB.1.5 sendo uma das principais circulantes no Tocantins no ano de 2023. As análises filogenéticas sugerem que o estado possa ter contribuído na dispersão das subvariantes não somente no Brasil como no mundo. Conclusões: Os resultados do presente estudo evidenciaram uma elevada prevalência da variante Ômicron no Tocantins entre dezembro de 2021 e junho de 2023, além de evidenciar que o estado pode ter contribuído para a dispersão da subvariante XBB.1.18.1 no Brasil. Relevância e impacto: É válido ressaltar, que devido à frequência elevada de mutações da variante Ômicron do SARS-CoV-2, é necessária uma vigilância para identificar possíveis novas entradas do vírus não somente no estado norte brasileiro como também em todo o país. | |
dc.description.sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES | |
dc.identifier.citation | SANTOS, M. S. Estudo epidemiológico e molecular da variante Omicron do SARS CoV-2 no Estado do Tocantins. 2024. 84 f. Tese (Doutorado em Medicina Tropical e Saúde Publica) - Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2024. | |
dc.identifier.uri | http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/13514 | |
dc.language | por | |
dc.publisher | Universidade Federal de Goiás | |
dc.publisher.country | Brasil | |
dc.publisher.department | Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RMG) | |
dc.publisher.initials | UFG | |
dc.publisher.program | Programa de Pós-graduação em Medicina Tropical e Saúde Publica (IPTSP) | |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International | en |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |
dc.subject | COVID-19 | por |
dc.subject | SARS-CoV-2 | por |
dc.subject | Omicron | por |
dc.subject | SAR-CoV-2 | eng |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA | |
dc.title | Estudo epidemiológico e molecular da variante Omicron do SARS-CoV-2 no Estado do Tocantins | |
dc.title.alternative | Epidemiological and molecular study of the Omicron variant of SARS-CoV-2 in the State of Tocantins | eng |
dc.type | Tese |
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